Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q57154 Date Thu Jan 5 12:37:14 GMT 2012 Unique Job ID aa5e856751bb910e

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	D	K	S	S	G	E	L	V	T	L	T	P	N	N	N	N	T	V	Q	P	V	A	L	M	R	L	G	V	F	V	P	T	L	K	S	L	K	N	S	K	K	N	T	L	S	R	T	D	A	T	E	E	L	T	R	L	S	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	A	E	G	F	D	K	V	E	I	T	G	P	R	L	D	M	D	N	D	F	K	T	W	V	G	I	I	H	S	F	A	R	H	N	V	I	G	D	K	V	E	L	P	F	V	E	F	A	K	L	C	G	I	P	S	S	Q	S	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?														?																		?																					?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	R	L	R	E	R	I	S	P	S	L	K	R	I	A	G	T	V	I	S	F	S	R	T	D	E	K	H	T	R	E	Y	I	T	H	L	V	Q	S	A	Y	Y	D	T	E	R	D	I	V	Q	L	Q	A	D	P	R	L	F	E	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Y	Q	F	D	R	K	V	L	L	Q	L	K	A	I	N	A	L	K	R	R	E	S	A	Q	A	L	Y	T	F	I	E	S	L	P	R	D	P	A	P	I	S	L	A	R	L	R	A	R	L	N	L	K	S	P	V	F	S	Q	N	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?																														?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		T	V	R	R	A	M	E	Q	L	R	E	I	G	Y	L	D	Y	T	E	I	Q	R	G	R	T	K	F	F	C	I	H	Y	R	R	P	R	L	K	A	P	N	D	E	S	K	E	N	P	L	P	P	S	P	A	E	K	V	S	P	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
Sequence		M	A	E	K	L	A	L	L	E	K	L	G	I	T	L	D	D	L	E	K	L	F	K	S	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?												?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand