Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P20966 Date Thu Jan 5 11:37:49 GMT 2012 Unique Job ID a9b06caa81121719

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	T	L	L	I	I	D	A	N	L	G	Q	A	R	A	Y	M	A	K	T	L	L	G	A	A	A	R	K	A	K	L	E	I	I	D	N	P	N	D	A	E	M	A	I	V	L	G	D	S	I	P	N	D	S	A	L	N	G	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?					?	?	?	?	?																			?	?	?	?	?	?		?																	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		N	V	W	L	G	D	I	S	R	A	V	A	H	P	E	L	F	L	S	E	A	K	G	H	A	K	P	Y	T	A	P	V	A	A	T	A	P	V	A	A	S	G	P	K	R	V	V	A	V	T	A	C	P	T	G	V	A	H	T	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?		?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		M	A	A	E	A	I	E	T	E	A	K	K	R	G	W	W	V	K	V	E	T	R	G	S	V	G	A	G	N	A	I	T	P	E	E	V	A	A	A	D	L	V	I	V	A	A	D	I	E	V	D	L	A	K	F	A	G	K	P	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?		?	?	?	?	?																			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Y	R	T	S	T	G	L	A	L	K	K	T	A	Q	E	L	D	K	A	V	A	E	A	T	P	Y	E	P	A	G	K	A	Q	T	A	T	T	E	S	K	K	E	S	A	G	A	Y	R	H	L	L	T	G	V	S	Y	M	L	P	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	V	A	G	G	L	C	I	A	L	S	F	A	F	G	I	E	A	F	K	E	P	G	T	L	A	A	A	L	M	Q	I	G	G	G	S	A	F	A	L	M	V	P	V	L	A	G	Y	I	A	F	S	I	A	D	R	P	G	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		P	G	L	I	G	G	M	L	A	V	S	T	G	S	G	F	I	G	G	I	I	A	G	F	L	A	G	Y	I	A	K	L	I	S	T	Q	L	K	L	P	Q	S	M	E	A	L	K	P	I	L	I	I	P	L	I	S	S	L	V	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	L	A	M	I	Y	L	I	G	K	P	V	A	G	I	L	E	G	L	T	H	W	L	Q	T	M	G	T	A	N	A	V	L	L	G	A	I	L	G	G	M	M	C	T	D	M	G	G	P	V	N	K	A	A	Y	A	F	G	V	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	L	S	T	Q	T	Y	G	P	M	A	A	I	M	A	A	G	M	V	P	P	L	A	M	G	L	A	T	M	V	A	R	R	K	F	D	K	A	Q	Q	E	G	G	K	A	A	L	V	L	G	L	C	F	I	S	E	G	A	I	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?												?																?								?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		F	A	A	R	D	P	M	R	V	L	P	C	C	I	V	G	G	A	L	T	G	A	I	S	M	A	I	G	A	K	L	M	A	P	H	G	G	L	F	V	L	L	I	P	G	A	I	T	P	V	L	G	Y	L	V	A	I	I	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?	?	?									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.
Sequence		T	L	V	A	G	L	A	Y	A	F	L	K	R	P	E	V	D	A	V	A	K	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand