Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P52138 Date Thu Jan 5 12:05:42 GMT 2012 Unique Job ID a9a9e7ecdfecb970

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	F	V	S	E	R	E	I	V	R	K	I	F	S	K	K	I	D	F	T	I	L	A	F	F	Y	I	S	S	I	F	F	L	L	C	S	G	V	L	F	Q	Y	F	T	A	A	F	T	K	G	N	C	Y	E	C	S	M	K	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		D	Y	I	K	Q	F	Y	F	S	L	E	T	A	W	Y	L	I	S	A	V	A	V	F	I	A	S	V	F	I	Q	H	R	I	K	A	Y	L	T	L	L	A	I	T	W	I	V	L	T	I	T	D	V	A	L	I	H	A	L	D	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	A	M	N	N	I	L	L	N	I	L	Y	N	L	F	G	A	I	L	L	S	L	F	M	C	L	S	N	S	L	L	F	H	L	N	K	I	K	H	I	P	M	I	L	S	A	M	I	P	L	V	S	A	I	I	I	A	I	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	A	V	I	Y	L	L	F	A	R	Q	A	V	E	I	E	M	D	I	S	E	G	S	D	I	A	Y	V	G	V	K	D	N	E	E	S	F	G	F	L	N	D	K	K	T	D	T	P	T	Y	L	D	V	I	K	N	G	S	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Y	N	D	T	Q	G	L	S	G	A	D	I	Y	I	V	S	G	C	Y	A	L	P	D	L	L	R	N	V	P	L	D	A	K	K	S	F	L	N	V	K	K	L	E	I	T	Q	K	L	P	M	M	G	F	I	Q	G	E	S	A	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?	?	?	?													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	M	P	K	A	A	S	R	L	S	L	S	K	Q	D	D	K	F	M	L	A	S	S	V	T	D	S	Q	I	K	F	K	S	N	N	A	Q	L	M	V	A	F	A	F	M	P	I	T	T	N	G	I	L	H	D	Y	T	Y	D	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?		?	?		?	?	?	?														?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	I	N	D	K	K	Y	K	I	E	N	H	V	A	P	L	S	R	L	D	K	N	K	K	M	K	C	E	Y	Q	Q	I	S	D	L	T	N	T	Y	N	I	N	A	N	Y	L	T	G	F	L	L	V	L	K	P	D	D	I	I	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?							?		?	?	?		?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		Y	N	N	S	P	S	V	L	L	K	T	D	F	A	F	Y	K	K	T	Y	Q	K	L	D	K	I	Y	D	D	I	S	N	G	K	L	S	S	L	R	A	T	G	I	S	Q	F	S	I	N	G	K	H	L	S	L	R	P	E	S	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?			?		?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		I	I	I	S	E	G	S	L	Y	G	L	V	N	K	S	K	K	I	K	I	Y	G	T	A	D	L	V	F	V	D	N	K	I	M	N	L	R	K	I	T	Y	L	Q	S	K	L	E	I	F	G	S	S	I	M	D	I	L	K	Y	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		F	G	L	G	L	L	A	I	S	I	K	F	I	H	S	Y	F	K	N	D	V	N	E	N	L	F	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand