Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P30136 Date Thu Jan 5 11:45:53 GMT 2012 Unique Job ID a986ba561ccc1d3a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	A	T	K	L	T	R	R	E	Q	R	A	R	A	Q	H	F	I	D	T	L	E	G	T	A	F	P	N	S	K	R	I	Y	I	T	G	T	H	P	G	V	R	V	P	M	R	E	I	Q	L	S	P	T	L	I	G	G	S	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?		?	?	?	?																								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	Q	P	Q	Y	E	E	N	E	A	I	P	V	Y	D	T	S	G	P	Y	G	D	P	Q	I	A	I	N	V	Q	Q	G	L	A	K	L	R	Q	P	W	I	D	A	R	G	D	T	E	E	L	T	V	R	S	S	D	Y	T	K	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																		?	?	?	?	?	?	?	?	?		?			?																?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	L	A	D	D	G	L	D	E	L	R	F	S	G	V	L	T	P	K	R	A	K	A	G	R	R	V	T	Q	L	H	Y	A	R	Q	G	I	I	T	P	E	M	E	F	I	A	I	R	E	N	M	G	R	E	R	I	R	S	E	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																							?		?	?	?				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	R	H	Q	H	P	G	M	S	F	G	A	H	L	P	E	N	I	T	A	E	F	V	R	D	E	V	A	A	G	R	A	I	I	P	A	N	I	N	H	P	E	S	E	P	M	I	I	G	R	N	F	L	V	K	V	N	A	N	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	N	S	A	V	T	S	S	I	E	E	E	V	E	K	L	V	W	S	T	R	W	G	A	D	T	V	M	D	L	S	T	G	R	Y	I	H	E	T	R	E	W	I	L	R	N	S	P	V	P	I	G	T	V	P	I	Y	Q	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		E	K	V	N	G	I	A	E	D	L	T	W	E	A	F	R	D	T	L	L	E	Q	A	E	Q	G	V	D	Y	F	T	I	H	A	G	V	L	L	R	Y	V	P	M	T	A	K	R	L	T	G	I	V	S	R	G	G	S	I	M	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?				?																																						?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		K	W	C	L	S	H	H	Q	E	N	F	L	Y	Q	H	F	R	E	I	C	E	I	C	A	A	Y	D	V	S	L	S	L	G	D	G	L	R	P	G	S	I	Q	D	A	N	D	E	A	Q	F	A	E	L	H	T	L	G	E	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?																																		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		K	I	A	W	E	Y	D	V	Q	V	M	I	E	G	P	G	H	V	P	M	Q	M	I	R	R	N	M	T	E	E	L	E	H	C	H	E	A	P	F	Y	T	L	G	P	L	T	T	D	I	A	P	G	Y	D	H	F	T	S	G	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		G	A	A	M	I	G	W	F	G	C	A	M	L	C	Y	V	T	P	K	E	H	L	G	L	P	N	K	E	D	V	K	Q	G	L	I	T	Y	K	I	A	A	H	A	A	D	L	A	K	G	H	P	G	A	Q	I	R	D	N	A	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		S	K	A	R	F	E	F	R	W	E	D	Q	F	N	L	A	L	D	P	F	T	A	R	A	Y	H	D	E	T	L	P	Q	E	S	G	K	V	A	H	F	C	S	M	C	G	P	K	F	C	S	M	K	I	S	Q	E	V	R	D	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.
Sequence		A	A	T	Q	T	I	E	M	G	M	A	D	M	S	E	N	F	R	A	R	G	G	E	I	Y	L	R	K	E	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?									?									?	?	?					?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand