Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AC33 Date Thu Jan 5 11:17:04 GMT 2012 Unique Job ID a93865b689503ba0

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	N	K	P	F	H	Y	Q	A	P	F	P	L	K	K	D	D	T	E	Y	Y	L	L	T	S	E	H	V	S	V	S	E	F	E	G	Q	E	I	L	K	V	A	P	E	A	L	T	L	L	A	R	Q	A	F	H	D	A	S	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?												?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		M	L	R	P	A	H	Q	Q	Q	V	A	D	I	L	R	D	P	E	A	S	E	N	D	K	Y	V	A	L	Q	F	L	R	N	S	D	I	A	A	K	G	V	L	P	T	C	Q	D	T	G	T	A	I	I	V	G	K	K	G	Q	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?			?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	W	T	G	G	G	D	E	A	A	L	A	R	G	V	Y	N	T	Y	I	E	D	N	L	R	Y	S	Q	N	A	P	L	D	M	Y	K	E	V	N	T	G	T	N	L	P	A	Q	I	D	L	Y	A	V	D	G	D	E	Y	K	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?		?				?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	C	I	A	K	G	G	G	S	A	N	K	T	Y	L	Y	Q	E	T	K	A	L	L	T	P	G	K	L	K	N	Y	L	V	E	K	M	R	T	L	G	T	A	A	C	P	P	Y	H	I	A	F	V	I	G	G	T	S	A	E	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		N	L	K	T	V	K	L	A	S	A	K	Y	Y	D	E	L	P	T	E	G	N	E	H	G	Q	A	F	R	D	V	E	L	E	K	E	L	L	I	E	A	Q	N	L	G	L	G	A	Q	F	G	G	K	Y	F	A	H	D	I	R	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?			?	?	?	?	?	?	?		?																	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	R	L	P	R	H	G	A	S	C	P	V	G	M	G	V	S	C	S	A	D	R	N	I	K	A	K	I	N	R	Q	G	I	W	I	E	K	L	E	H	N	P	G	K	Y	I	P	E	E	L	R	K	A	G	E	G	E	A	V	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																						?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		V	D	L	N	R	P	M	K	E	I	L	A	Q	L	S	Q	Y	P	V	S	T	R	L	S	L	N	G	T	I	I	V	G	R	D	I	A	H	A	K	L	K	E	R	M	D	N	G	E	G	L	P	Q	Y	I	K	D	H	P	I	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		Y	A	G	P	A	K	T	P	E	G	Y	A	S	G	S	L	G	P	T	T	A	G	R	M	D	S	Y	V	D	Q	L	Q	A	Q	G	G	S	M	I	M	L	A	K	G	N	R	S	Q	Q	V	T	D	A	C	K	K	H	G	G	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		Y	L	G	S	I	G	G	P	A	A	V	L	A	Q	G	S	I	K	S	L	E	C	V	E	Y	P	E	L	G	M	E	A	I	W	K	I	E	V	E	D	F	P	A	F	I	L	V	D	D	K	G	N	D	F	F	Q	Q	I	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		T	Q	C	T	R	C	V	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand