Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AGM7 Date Thu Jan 5 11:29:32 GMT 2012 Unique Job ID a8ddb60506a65af3

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	R	R	A	I	G	V	S	E	R	P	P	L	L	Q	T	I	P	L	S	L	Q	H	L	F	A	M	F	G	A	T	V	L	V	P	V	L	F	H	I	N	P	A	T	V	L	L	F	N	G	I	G	T	L	L	Y	L	F	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		C	K	G	K	I	P	A	Y	L	G	S	S	F	A	F	I	S	P	V	L	L	L	L	P	L	G	Y	E	V	A	L	G	G	F	I	M	C	G	V	L	F	C	L	V	S	F	I	V	K	K	A	G	T	G	W	L	D	V	L	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?		?																										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		P	P	A	A	M	G	A	I	V	A	V	I	G	L	E	L	A	G	V	A	A	G	M	A	G	L	L	P	A	E	G	Q	T	P	D	S	K	T	I	I	I	S	I	T	T	L	A	V	T	V	L	G	S	V	L	F	R	G	F	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																										?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	I	I	P	I	L	I	G	V	L	V	G	Y	A	L	S	F	A	M	G	I	V	D	T	T	P	I	I	N	A	H	W	F	A	L	P	T	L	Y	T	P	R	F	E	W	F	A	I	L	T	I	L	P	A	A	L	V	V	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																									?		?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	H	V	G	H	L	V	V	T	A	N	I	V	K	K	D	L	L	R	D	P	G	L	H	R	S	M	F	A	N	G	L	S	T	V	I	S	G	F	F	G	S	T	P	N	T	T	Y	G	E	N	I	G	V	M	A	I	T	R	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																			?		?	?	?	?	?	?										?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Y	S	T	W	V	I	G	G	A	A	I	F	A	I	L	L	S	C	V	G	K	L	A	A	A	I	Q	M	I	P	L	P	V	M	G	G	V	S	L	L	L	Y	G	V	I	G	A	S	G	I	R	V	L	I	E	S	K	V	D	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																																					?		?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		N	K	A	Q	N	L	I	L	T	S	V	I	L	I	I	G	V	S	G	A	K	V	N	I	G	A	A	E	L	K	G	M	A	L	A	T	I	V	G	I	G	L	S	L	I	F	K	L	I	S	V	L	R	P	E	E	V	V	L	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?																		?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		A	E	D	A	D	I	T	D	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand