Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P75835 Date Thu Jan 5 12:14:49 GMT 2012 Unique Job ID a85d1786ee9aa91b

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	G	N	V	Q	E	K	Q	L	R	W	Y	N	I	A	L	M	S	F	I	T	V	W	G	F	G	N	V	V	N	N	Y	A	N	Q	G	L	V	V	V	F	S	W	V	F	I	F	A	L	Y	F	T	P	Y	A	L	I	V	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?																?	?	?	?	?						?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Q	L	G	S	T	F	K	D	G	K	G	G	V	S	T	W	I	K	H	T	M	G	P	G	L	A	Y	L	A	A	W	T	Y	W	V	V	H	I	P	Y	L	A	Q	K	P	Q	A	I	L	I	A	L	G	W	A	M	K	G	D	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	L	I	K	E	Y	S	V	V	A	L	Q	G	L	T	L	V	L	F	I	F	F	M	W	V	A	S	R	G	M	K	S	L	K	I	V	G	S	V	A	G	I	A	M	F	V	M	S	L	L	Y	V	A	M	A	V	T	A	P	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	T	E	V	H	I	A	T	T	N	I	T	W	E	T	F	I	P	H	I	D	F	T	Y	I	T	T	I	S	M	L	V	F	A	V	G	G	A	E	K	I	S	P	Y	V	N	Q	T	R	N	P	G	K	E	F	P	K	G	M	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?			?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		C	L	A	V	M	V	A	V	C	A	I	L	G	S	L	A	M	G	M	M	F	D	S	R	N	I	P	D	D	L	M	T	N	G	Q	Y	Y	A	F	Q	K	L	G	E	Y	Y	N	M	G	N	T	L	M	V	I	Y	A	I	A	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	L	G	Q	V	A	A	L	V	F	S	I	D	A	P	L	K	V	L	L	G	D	A	D	S	K	Y	I	P	A	S	L	C	R	T	N	A	S	G	T	P	V	N	G	Y	F	L	T	L	V	L	V	A	I	L	I	M	L	P	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	G	I	G	D	M	N	N	L	Y	K	W	L	L	N	L	N	S	V	V	M	P	L	R	Y	L	W	V	F	V	A	F	I	A	V	V	R	L	A	Q	K	Y	K	P	E	Y	V	F	I	R	N	K	P	L	A	M	T	V	G	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																																			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.
Sequence		W	C	F	A	F	T	A	F	A	C	L	T	G	I	F	P	K	M	E	A	F	T	A	E	W	T	F	Q	L	A	L	N	V	A	T	P	F	V	L	V	G	L	G	L	I	F	P	L	L	A	R	K	A	N	S	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?	?	?	?	?																												?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand