Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P25665 Date Thu Jan 5 11:42:13 GMT 2012 Unique Job ID a846860cea4aae9d

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	I	L	N	H	T	L	G	F	P	R	V	G	L	R	R	E	L	K	K	A	Q	E	S	Y	W	A	G	N	S	T	R	E	E	L	L	A	V	G	R	E	L	R	A	R	H	W	D	Q	Q	K	Q	A	G	I	D	L	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																					?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	G	D	F	A	W	Y	D	H	V	L	T	T	S	L	L	L	G	N	V	P	A	R	H	Q	N	K	D	G	S	V	D	I	D	T	L	F	R	I	G	R	G	R	A	P	T	G	E	P	A	A	A	A	E	M	T	K	W	F	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?	?	?	?												?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	N	Y	H	Y	M	V	P	E	F	V	K	G	Q	Q	F	K	L	T	W	T	Q	L	L	D	E	V	D	E	A	L	A	L	G	H	K	V	K	P	V	L	L	G	P	V	T	W	L	W	L	G	K	V	K	G	E	Q	F	D	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?																																						?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	S	L	L	N	D	I	L	P	V	Y	Q	Q	V	L	A	E	L	A	K	R	G	I	E	W	V	Q	I	D	E	P	A	L	V	L	E	L	P	Q	A	W	L	D	A	Y	K	P	A	Y	D	A	L	Q	G	Q	V	K	L	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		T	T	Y	F	E	G	V	T	P	N	L	D	T	I	T	A	L	P	V	Q	G	L	H	V	D	L	V	H	G	K	D	D	V	A	E	L	H	K	R	L	P	S	D	W	L	L	S	A	G	L	I	N	G	R	N	V	W	R	A	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	T	E	K	Y	A	Q	I	K	D	I	V	G	K	R	D	L	W	V	A	S	S	C	S	L	L	H	S	P	I	D	L	S	V	E	T	R	L	D	A	E	V	K	S	W	F	A	F	A	L	Q	K	C	H	E	L	A	L	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		D	A	L	N	S	G	D	T	A	A	L	A	E	W	S	A	P	I	Q	A	R	R	H	S	T	R	V	H	N	P	A	V	E	K	R	L	A	A	I	T	A	Q	D	S	Q	R	A	N	V	Y	E	V	R	A	E	A	Q	R	A	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?									?							?	?		?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		F	K	L	P	A	W	P	T	T	T	I	G	S	F	P	Q	T	T	E	I	R	T	L	R	L	D	F	K	K	G	N	L	D	A	N	N	Y	R	T	G	I	A	E	H	I	K	Q	A	I	V	E	Q	E	R	L	G	L	D	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		V	H	G	E	A	E	R	N	D	M	V	E	Y	F	G	E	H	L	D	G	F	V	F	T	Q	N	G	W	V	Q	S	Y	G	S	R	C	V	K	P	P	I	V	I	G	D	I	S	R	P	A	P	I	T	V	E	W	A	K	Y	A
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		Q	S	L	T	D	K	P	V	K	G	M	L	T	G	P	V	T	I	L	C	W	S	F	P	R	E	D	V	S	R	E	T	I	A	K	Q	I	A	L	A	L	R	D	E	V	A	D	L	E	A	A	G	I	G	I	I	Q	I	D	E
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		P	A	L	R	E	G	L	P	L	R	R	S	D	W	D	A	Y	L	Q	W	G	V	E	A	F	R	I	N	A	A	V	A	K	D	D	T	Q	I	H	T	H	M	C	Y	C	E	F	N	D	I	M	D	S	I	A	A	L	D	A	D
Secondary structure
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Disorder									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		V	I	T	I	E	T	S	R	S	D	M	E	L	L	E	S	F	E	E	F	D	Y	P	N	E	I	G	P	G	V	Y	D	I	H	S	P	N	V	P	S	V	E	W	I	E	A	L	L	K	K	A	A	K	R	I	P	A	E	R	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.
Sequence		W	V	N	P	D	C	G	L	K	T	R	G	W	P	E	T	R	A	A	L	A	N	M	V	Q	A	A	Q	N	L	R	R	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?																			?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand