Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77359 Date Thu Jan 5 12:28:09 GMT 2012 Unique Job ID a807daf83dbeae6e

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	T	C	W	Q	I	L	E	I	E	S	T	T	Q	I	D	I	I	R	Q	A	Y	L	A	R	L	P	L	C	H	P	E	T	D	P	Q	G	F	K	A	L	R	Q	A	Y	E	E	A	L	R	L	A	V	N	P	V	E	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?									?	?	?	?																		?	?	?																			?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		D	D	E	E	K	D	A	A	A	E	H	E	I	L	R	A	F	R	T	L	L	D	S	E	S	D	R	F	Q	P	S	A	W	Q	K	F	I	Q	Q	L	N	T	W	N	M	E	D	V	D	Q	L	R	W	P	L	C	A	I	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?	?	?		?	?	?	?													?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	A	R	Y	L	S	L	N	C	A	S	L	L	A	E	R	L	N	W	H	S	F	N	D	S	E	G	M	D	E	E	E	R	E	A	F	L	E	A	I	Q	A	G	D	C	F	D	F	L	S	L	L	E	Y	P	I	A	L	Q	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Q	T	V	E	Y	Y	F	A	L	E	R	C	C	R	Y	H	P	D	Y	V	T	A	F	L	A	M	E	G	P	W	L	I	P	D	D	A	K	L	H	R	K	L	L	R	W	Y	S	S	V	Q	T	G	M	A	E	L	I	P	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Q	Q	W	Q	T	E	E	P	E	S	E	D	A	R	Y	Y	L	C	A	Q	R	L	Y	C	G	E	G	E	S	L	L	A	D	L	C	A	Y	W	E	S	Y	P	S	T	Q	A	D	N	L	L	L	Q	W	S	K	R	H	C	P	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Y	F	A	L	L	V	M	V	I	E	A	R	S	M	V	D	A	Q	G	Q	P	L	K	Y	V	P	G	E	S	A	R	T	R	L	L	W	A	E	I	L	H	S	G	K	L	S	P	L	G	Q	S	F	I	E	S	L	F	F	K	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?				?	?																								?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		K	A	W	A	W	W	K	S	R	V	G	S	E	T	E	Q	D	S	P	F	L	D	L	Y	R	V	A	E	Q	V	V	L	E	A	F	P	K	Q	E	M	L	A	R	L	N	T	R	L	E	G	G	D	A	H	P	L	E	A	I	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																					?									?	?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		T	R	M	L	L	T	K	V	K	L	E	P	E	D	E	D	V	D	E	P	T	P	E	N	H	E	E	K	N	D	E	G	E	K	P	Q	S	I	T	S	I	I	K	I	S	L	T	V	L	V	I	G	Y	A	L	G	K	I	A	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.
Sequence		L	F	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand