Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P33924 Date Thu Jan 5 11:52:48 GMT 2012 Unique Job ID a7f304782f22c829

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	H	Q	S	G	S	V	S	L	C	R	S	A	I	S	V	L	V	A	T	A	L	Y	S	P	I	A	L	A	S	T	V	E	Y	G	E	T	V	D	G	V	V	L	E	K	D	I	Q	L	V	Y	G	T	A	N	N	T	K	I	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?									?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?										?	?	?	?	?							?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	G	G	E	Q	H	I	K	E	F	G	V	S	N	N	T	E	I	N	G	G	Y	Q	Y	I	E	M	N	G	A	A	E	Y	S	V	L	N	D	G	Y	Q	I	V	Q	M	G	G	A	A	N	Q	T	T	L	N	N	G	V	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?				?	?	?					?			?					?	?	?	?		?													?			?	?	?	?					?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	Y	G	A	A	N	D	T	T	I	K	G	G	R	L	I	V	E	K	D	G	G	A	V	F	V	A	I	E	K	G	G	L	L	E	V	K	E	G	G	F	A	F	A	V	D	Q	K	A	G	G	A	I	K	T	T	T	R	A	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?											?	?			?	?														?	?	?	?	?														?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	V	F	G	T	N	R	L	G	Q	F	D	I	K	N	G	I	A	N	N	M	L	L	E	N	G	G	S	L	R	V	E	E	N	D	F	A	Y	N	T	T	V	D	S	G	G	L	L	E	V	M	D	G	G	T	V	T	G	V	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?		?	?	?	?																							?								?	?	?	?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	K	A	G	G	K	L	I	V	S	T	N	A	L	E	V	S	G	P	N	S	K	G	Q	F	S	I	K	D	G	V	S	K	N	Y	E	L	D	D	G	S	G	L	I	V	M	E	D	T	Q	A	I	D	T	I	L	D	K	H	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?		?	?					?	?	?	?	?			?	?	?	?		?										?	?	?						?	?																	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	M	Q	S	L	G	K	D	T	G	T	K	V	Q	A	N	A	V	Y	D	L	G	R	S	Y	Q	N	G	S	I	T	Y	S	S	K	A	I	S	E	N	M	V	I	N	N	G	R	A	N	V	W	A	G	T	M	V	N	V	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?			?	?	?	?	?	?							?	?	?		?	?	?										?	?				?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		R	G	N	D	G	I	L	E	V	M	K	P	Q	I	N	Y	A	P	A	M	L	V	G	K	V	V	V	S	E	G	A	S	F	R	T	H	G	A	V	D	T	S	K	A	D	V	S	L	E	N	S	V	W	T	I	I	A	D	I	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?		?	?	?																					?	?	?			?							?	?			?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		T	T	N	Q	N	T	L	L	N	L	A	N	L	A	M	S	D	A	N	V	I	M	M	D	E	P	V	T	R	S	S	V	T	A	S	A	E	N	F	I	T	L	T	T	N	T	L	S	G	N	G	N	F	Y	M	R	T	D	M	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?		?	?	?								?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		N	H	Q	S	D	Q	L	N	V	T	G	Q	A	T	G	D	F	K	I	F	V	T	D	T	G	A	S	P	A	A	G	D	S	L	T	L	V	T	T	G	G	G	D	A	A	F	T	L	G	N	A	G	G	V	V	D	I	G	T	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?		?	?	?	?	?	?	?	?	?								?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		E	Y	T	L	L	D	N	G	N	H	S	W	S	L	A	E	N	R	A	Q	I	T	P	S	T	T	D	V	L	N	M	A	A	A	Q	P	L	V	F	D	A	E	L	D	T	V	R	E	R	L	G	S	V	K	G	V	S	Y	D	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		A	M	W	S	S	A	I	N	T	R	N	N	V	T	T	D	A	G	A	G	F	E	Q	T	L	T	G	L	T	L	G	I	D	S	R	F	S	R	E	E	S	S	T	I	R	G	L	I	F	G	Y	S	H	S	D	I	G	F	D	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		G	G	K	G	N	I	D	S	Y	T	L	G	A	Y	A	G	W	E	H	Q	N	G	A	Y	V	D	G	V	V	K	V	D	R	F	A	N	T	I	H	G	K	M	S	N	G	A	T	A	F	G	D	Y	N	S	N	G	A	G	A	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																															?					?	?	?	?	?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		V	E	S	G	F	R	W	V	D	G	L	W	S	V	R	P	Y	L	A	F	T	G	F	T	T	D	G	Q	D	Y	T	L	S	N	G	M	R	A	D	V	G	N	T	R	I	L	R	A	E	A	G	T	A	V	S	Y	H	M	D	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?		?	?	?	?	?	?	?					?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		Q	N	G	T	T	L	E	P	W	L	K	A	A	V	R	Q	E	Y	A	D	S	N	Q	V	K	V	N	D	D	G	K	F	N	N	D	V	A	G	T	S	G	V	Y	Q	A	G	I	R	S	S	F	T	P	T	L	S	G	H	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.
Sequence		V	S	Y	G	N	G	A	G	V	E	S	P	W	N	T	Q	A	G	V	V	W	T	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?	?	?	?											?
Disorder confidence