Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77561 Date Thu Jan 5 12:30:35 GMT 2012 Unique Job ID a7095d54128e7d0f

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	K	K	I	E	S	Y	Q	G	A	A	G	G	W	G	A	V	K	S	V	A	N	A	V	R	K	Q	M	D	I	R	Q	D	V	I	A	M	F	D	M	N	K	P	E	G	F	D	C	P	G	C	A	W	P	D	P	K	H	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?			?
Disorder confidence
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Sequence		A	S	F	D	I	C	E	N	G	A	K	A	I	A	W	E	V	T	D	K	Q	V	N	A	S	F	F	A	E	N	T	V	Q	S	L	L	T	W	G	D	H	E	L	E	A	A	G	R	L	T	Q	P	L	K	Y	D	A	V	S	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?					?																			?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		C	Y	K	P	L	S	W	Q	Q	A	F	D	E	I	G	A	R	L	Q	S	Y	S	D	P	N	Q	V	E	F	Y	T	S	G	R	T	S	N	E	A	A	F	L	Y	Q	L	F	A	R	E	Y	G	S	N	N	F	P	D	C	S	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		M	C	H	E	P	T	S	V	G	L	A	A	S	I	G	V	G	K	G	T	V	L	L	E	D	F	E	K	C	D	L	V	I	C	I	G	H	N	P	G	T	N	H	P	R	M	L	T	S	L	R	A	L	V	K	R	G	A	K	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	A	I	N	P	L	Q	E	R	G	L	E	R	F	T	A	P	Q	N	P	F	E	M	L	T	N	S	E	T	Q	L	A	S	A	Y	Y	N	V	R	I	G	G	D	M	A	L	L	K	G	M	M	R	L	L	I	E	R	D	D	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?																																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	S	A	A	G	R	P	S	L	L	D	D	E	F	I	Q	T	H	T	V	G	F	D	E	L	R	R	D	V	L	N	S	E	W	K	D	I	E	R	I	S	G	L	S	Q	T	Q	I	A	E	L	A	D	A	Y	A	A	A	E	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		T	I	I	C	Y	G	M	G	I	T	Q	H	E	H	G	T	Q	N	V	Q	Q	L	V	N	L	L	L	M	K	G	N	I	G	K	P	G	A	G	I	C	P	L	R	G	H	S	N	V	Q	G	D	R	T	V	G	I	T	E	K	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		S	A	E	F	L	A	R	L	G	E	R	Y	G	F	T	P	P	H	A	P	G	H	A	A	I	A	S	M	Q	A	I	C	T	G	Q	A	R	A	L	I	C	M	G	G	N	F	A	L	A	M	P	D	R	E	A	S	A	V	P	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		T	Q	L	D	L	A	V	H	V	A	T	K	L	N	R	S	H	L	L	T	A	R	H	S	Y	I	L	P	V	L	G	R	S	E	I	D	M	Q	K	N	G	A	Q	A	V	T	V	E	D	S	M	S	M	I	H	A	S	R	G	V
Secondary structure
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Disorder																																										?
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Sequence		L	K	P	A	G	V	M	L	K	S	E	C	A	V	V	A	G	I	A	Q	A	A	L	P	Q	S	V	V	A	W	E	Y	L	V	E	D	Y	D	R	I	R	N	D	I	E	A	V	L	P	E	F	A	D	Y	N	Q	R	I	R	H
Secondary structure
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		P	G	G	F	H	L	I	N	A	A	A	E	R	R	W	M	T	P	S	G	K	A	N	F	I	T	S	K	G	L	L	E	D	P	S	S	A	F	N	S	K	L	V	M	A	T	V	R	S	H	D	Q	Y	N	T	T	I	Y	G	M
Secondary structure
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Disorder																																																								?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		D	D	R	Y	R	G	V	F	G	Q	R	D	V	V	F	M	S	A	K	Q	A	K	I	C	R	V	K	N	G	E	R	V	N	L	I	A	L	T	P	D	G	K	R	S	S	R	R	M	D	R	L	K	V	V	I	Y	P	M	A	D
Secondary structure
SS confidence
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		R	S	L	V	T	Y	F	P	E	S	N	H	M	L	T	L	D	N	H	D	P	L	S	G	I	P	G	Y	K	S	I	P	V	E	L	E	P	S	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																							?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand