Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P46133 Date Thu Jan 5 12:04:06 GMT 2012 Unique Job ID a6d5f50ae1241294

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	M	S	S	I	P	S	S	S	Q	S	G	K	L	Y	G	W	V	E	R	I	G	N	K	V	P	H	P	F	L	L	F	I	Y	L	I	I	V	L	M	V	T	T	A	I	L	S	A	F	G	V	S	A	K	N	P	T	D	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																															?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	P	V	V	V	K	N	L	L	S	V	E	G	L	H	W	F	L	P	N	V	I	K	N	F	S	G	F	A	P	L	G	A	I	L	A	L	V	L	G	A	G	L	A	E	R	V	G	L	L	P	A	L	M	V	K	M	A	S	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?				?																		?	?	?																																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	N	A	R	Y	A	S	Y	M	V	L	F	I	A	F	F	S	H	I	S	S	D	A	A	L	V	I	M	P	P	M	G	A	L	I	F	L	A	V	G	R	H	P	V	A	G	L	L	A	A	I	A	G	V	G	C	G	F	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		N	L	L	I	V	T	T	D	V	L	L	S	G	I	S	T	E	A	A	A	A	F	N	P	Q	M	H	V	S	V	I	D	N	W	Y	F	M	A	S	S	V	V	V	L	T	I	V	G	G	L	I	T	D	K	I	I	E	P	R	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?			?									?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	Q	W	Q	G	N	S	D	E	K	L	Q	T	L	T	E	S	Q	R	F	G	L	R	I	A	G	V	V	S	L	L	F	I	A	A	I	A	L	M	V	I	P	Q	N	G	I	L	R	D	P	I	N	H	T	V	M	P	S	P	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	K	G	I	V	P	L	I	I	L	F	F	F	V	V	S	L	A	Y	G	I	A	T	R	T	I	R	R	Q	A	D	L	P	H	L	M	I	E	P	M	K	E	M	A	G	F	I	V	M	V	F	P	L	A	Q	F	V	A	M	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		N	W	S	N	M	G	K	F	I	A	V	G	L	T	D	I	L	E	S	S	G	L	S	G	I	P	A	F	V	G	L	A	L	L	S	S	F	L	C	M	F	I	A	S	G	S	A	I	W	S	I	L	A	P	I	F	V	P	M	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?		?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		M	L	L	G	F	H	P	A	F	A	Q	I	L	F	R	I	A	D	S	S	V	L	P	L	A	P	V	S	P	F	V	P	L	F	L	G	F	L	Q	R	Y	K	P	D	A	K	L	G	T	Y	Y	S	L	V	L	P	Y	P	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		F	L	V	V	W	L	L	M	L	L	A	W	Y	L	V	G	L	P	I	G	P	G	I	Y	P	R	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand