Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P45758 Date Thu Jan 5 12:03:35 GMT 2012 Unique Job ID a697e370707bcc55

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	G	L	N	K	I	T	C	C	L	L	A	A	L	L	M	P	C	A	G	H	A	E	N	E	Q	Y	G	A	N	F	N	N	A	D	I	R	Q	F	V	E	I	V	G	Q	H	L	G	K	T	I	L	I	D	P	S	V	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																							?									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	I	S	V	R	S	N	D	T	F	S	Q	Q	E	Y	Y	Q	F	F	L	S	I	L	D	L	Y	G	Y	S	V	I	T	L	D	N	G	F	L	K	V	V	R	S	A	N	V	K	T	S	P	G	M	I	A	D	S	S	R	P	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?																																	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	G	D	E	L	V	T	R	I	V	P	L	E	N	V	P	A	R	D	L	A	P	L	L	R	Q	M	M	D	A	G	S	V	G	N	V	V	H	Y	E	P	S	N	V	L	I	L	T	G	R	A	S	T	I	N	K	L	I	E	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?		?																						?	?	?	?	?	?	?	?							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	K	R	V	D	V	I	G	T	E	K	Q	Q	I	I	H	L	E	Y	A	S	A	E	D	L	A	E	I	L	N	Q	L	I	S	E	S	H	G	K	S	Q	M	P	A	L	L	S	A	K	I	V	A	D	K	R	T	N	S	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?		?	?	?	?	?											?	?		?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	S	G	P	E	K	A	R	Q	R	I	T	S	L	L	K	S	L	D	V	E	E	S	E	E	G	N	T	R	V	Y	Y	L	K	Y	A	K	A	T	N	L	V	E	V	L	T	G	V	S	E	K	L	K	D	E	K	G	N	A	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		K	P	S	S	S	G	A	M	D	N	V	A	I	T	A	D	E	Q	T	N	S	L	V	I	T	A	D	Q	S	V	Q	E	K	L	A	T	V	I	A	R	L	D	I	R	R	A	Q	V	L	V	E	A	I	I	V	E	V	Q	D	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		N	G	L	N	L	G	V	Q	W	A	N	K	N	V	G	A	Q	Q	F	T	N	T	G	L	P	I	F	N	A	A	Q	G	V	A	D	Y	K	K	N	G	G	I	T	S	A	N	P	A	W	D	M	F	S	A	Y	N	G	M	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	F	F	N	G	D	W	G	V	L	L	T	A	L	A	S	N	N	K	N	D	I	L	A	T	P	S	I	V	T	L	D	N	K	L	A	S	F	N	V	G	Q	D	V	P	V	L	S	G	S	Q	T	T	S	G	D	N	V	F	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?			?	?											?	?	?																													?	?		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		T	V	E	R	K	T	V	G	T	K	L	K	V	T	P	Q	V	N	E	G	D	A	V	L	L	E	I	E	Q	E	V	S	S	V	D	S	S	S	N	S	T	L	G	P	T	F	N	T	R	T	I	Q	N	A	V	L	V	K	T	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?													?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		E	T	V	V	L	G	G	L	L	D	D	F	S	K	E	Q	V	S	K	V	P	L	L	G	D	I	P	L	V	G	Q	L	F	R	Y	T	S	T	E	R	A	K	R	N	L	M	V	F	I	R	P	T	I	I	R	D	D	D	V	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?														?	?	?	?	?	?	?	?	?																?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650
Sequence		R	S	L	S	K	E	K	Y	T	R	Y	R	Q	E	Q	Q	Q	R	I	D	G	K	S	K	A	L	V	G	S	E	D	L	P	V	L	D	E	N	T	F	N	S	H	A	P	A	P	S	S	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?			?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand