Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P34749 Date Thu Jan 5 11:53:09 GMT 2012 Unique Job ID a510de9620fac5ae

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	Q	W	I	A	A	L	L	L	M	L	I	P	G	V	Q	A	A	K	P	Q	K	V	T	L	M	V	D	D	V	P	V	A	Q	V	L	Q	A	L	A	E	Q	E	K	L	N	L	V	V	S	P	D	V	S	G	T	V	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?										?	?	?	?	?	?	?	?	?																																?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		H	L	T	D	V	P	W	K	Q	A	L	Q	T	V	V	K	S	A	G	L	I	T	R	Q	E	G	N	I	L	S	V	H	S	I	A	W	Q	N	N	N	I	A	R	Q	E	A	E	Q	A	R	A	Q	A	N	L	P	L	E	N	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	I	T	L	Q	Y	A	D	A	G	E	L	A	K	A	G	E	K	L	L	S	A	K	G	S	M	T	V	D	K	R	T	N	R	L	L	L	R	D	N	K	T	A	L	S	A	L	E	Q	W	V	A	Q	M	D	L	P	V	G	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?											?	?	?	?	?	?																																		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	E	L	S	A	H	I	V	T	I	N	E	K	S	L	R	E	L	G	V	K	W	T	L	A	D	A	Q	H	A	G	G	V	G	Q	V	T	T	L	G	S	D	L	S	V	A	T	A	T	T	H	V	G	F	N	I	G	R	I	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	R	L	L	D	L	E	L	S	A	L	E	Q	K	Q	Q	L	D	I	I	A	S	P	R	L	L	A	S	H	L	Q	P	A	S	I	K	Q	G	S	E	I	P	Y	Q	V	S	S	G	E	S	G	A	T	S	V	E	F	K	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?														?	?	?																														?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	L	G	M	E	V	T	P	T	V	L	Q	K	G	R	I	R	L	K	L	H	I	S	Q	N	V	P	G	Q	V	L	Q	Q	A	D	G	E	V	L	A	I	D	K	Q	E	I	E	T	Q	V	E	V	K	S	G	E	T	L	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.
Sequence		G	G	I	F	T	R	K	N	K	S	G	Q	D	S	V	P	L	L	G	D	I	P	W	F	G	Q	L	F	R	H	D	G	K	E	D	E	R	R	E	L	V	V	F	I	T	P	R	L	V	S	S	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?	?	?															?	?	?	?	?	?	?	?												?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand