Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P36682 Date Thu Jan 5 11:53:47 GMT 2012 Unique Job ID a3f7b54b27d8afa6

Secondary structure and disorder prediction

1

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10

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20

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30

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40

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50

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60

Sequence

M

K

M

T

L

P

F

K

P

H

V

L

A

L

I

C

S

A

G

L

C

A

A

S

T

G

L

Y

I

K

S

R

T

V

E

A

P

V

E

P

Q

S

T

Q

L

A

V

S

D

A

A

A

V

T

F

P

A

T

V

S

Secondary structure

SS confidence

Disorder

?

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?

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?

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?

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?

Disorder confidence

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70

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80

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90

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100

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110

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120

Sequence

A

P

P

V

T

P

A

V

V

K

S

A

F

S

T

A

Q

I

D

Q

W

V

A

P

V

A

L

Y

P

D

A

L

L

S

Q

V

L

M

A

S

T

Y

P

T

N

V

A

Q

A

V

Q

W

S

H

D

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P

L

K

Q

Secondary structure

SS confidence

Disorder

?

?

?

?

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?

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Disorder confidence

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130

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140

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150

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160

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170

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180

Sequence

G

D

A

A

I

Q

A

V

S

D

Q

P

W

D

A

S

V

K

S

L

V

A

F

P

Q

L

M

A

L

M

G

E

N

P

Q

W

V

Q

N

L

G

D

A

F

L

A

Q

P

Q

D

V

M

D

S

V

Q

R

L

R

Q

Secondary structure

SS confidence

Disorder

?

?

?

Disorder confidence

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190

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200

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210

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220

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230

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240

Sequence

L

A

Q

Q

T

G

S

L

K

S

S

T

E

Q

K

V

I

T

T

T

K

K

A

V

P

V

K

Q

T

V

T

A

P

V

I

P

S

N

T

V

L

T

A

N

P

V

I

T

E

P

A

T

T

V

I

S

I

E

P

A

Secondary structure

SS confidence

Disorder

?

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?

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?

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Disorder confidence

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250

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260

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270

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280

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290

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300

Sequence

N

P

D

V

V

Y

I

P

N

Y

N

P

T

V

V

Y

G

N

W

A

N

T

A

Y

P

P

V

Y

L

P

P

P

A

G

E

P

F

V

D

S

F

V

R

G

F

G

Y

S

M

G

V

A

T

T

Y

A

L

F

S

S

Secondary structure

SS confidence

Disorder

Disorder confidence

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310

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320

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330

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340

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350

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360

Sequence

I

D

W

D

D

D

D

H

D

H

H

H

H

D

N

D

D

Y

H

H

H

D

G

G

H

R

D

G

N

G

W

Q

H

N

G

D

N

I

N

I

D

V

N

N

F

N

R

I

T

G

E

H

L

T

D

K

N

M

A

W

Secondary structure

SS confidence

Disorder

?

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Disorder confidence

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370

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380

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390

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400

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410

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420

Sequence

R

H

N

P

N

Y

R

N

G

V

P

Y

H

D

Q

D

M

A

K

R

F

H

Q

T

D

V

N

G

G

M

S

A

T

Q

L

P

A

P

T

R

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S

Q

R

Q

A

A

A

N

Q

F

Q

Q

R

T

H

A

A

P

V

Secondary structure

SS confidence

Disorder

?

?

?

?

?

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Disorder confidence

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430

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440

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450

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460

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470

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480

Sequence

I

T

R

D

T

Q

R

Q

A

A

A

Q

R

F

N

E

A

E

H

Y

G

S

Y

D

D

F

H

D

F

S

R

R

Q

P

L

T

Q

Q

Q

K

D

A

A

R

Q

R

Y

Q

S

A

S

P

E

Q

R

Q

A

V

R

E

Secondary structure

SS confidence

Disorder

?

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Disorder confidence

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490

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500

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510

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520

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530

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540

Sequence

R

M

Q

T

N

P

K

I

Q

Q

R

R

E

A

A

R

E

R

I

Q

S

A

S

P

E

Q

R

Q

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V

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E

K

M

Q

T

N

P

Q

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Q

Q

R

R

D

A

A

R

E

R

I

Q

S

A

S

P

E

Q

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Q

Secondary structure

SS confidence

Disorder

?

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?

Disorder confidence

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550

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560

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570

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580

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590

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600

Sequence

V

F

K

E

K

V

Q

Q

R

P

L

N

Q

Q

Q

R

D

N

A

R

Q

R

V

Q

S

A

S

P

E

Q

R

Q

V

F

R

E

K

V

Q

E

S

R

P

Q

R

L

N

D

S

N

H

T

V

R

L

N

N

E

Q

R

Secondary structure

SS confidence

Disorder

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Disorder confidence

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610

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Sequence

S

A

V

C

E

R

L

S

E

R

G

A

R

R

L

E

R

Secondary structure

SS confidence

Disorder

?

?

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?

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?

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?

Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand