Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76397 Date Thu Jan 5 12:22:38 GMT 2012 Unique Job ID a336832eac117eb3

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	G	S	Y	K	S	R	W	V	I	V	I	V	V	V	I	A	A	I	A	A	F	W	F	W	Q	G	R	N	D	S	R	S	A	A	P	G	A	T	K	Q	A	Q	Q	S	P	A	G	G	R	R	G	M	R	S	G	P	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		P	V	Q	A	A	T	A	V	E	Q	A	V	P	R	Y	L	T	G	L	G	T	I	T	A	A	N	T	V	T	V	R	S	R	V	D	G	Q	L	I	A	L	H	F	Q	E	G	Q	Q	V	K	A	G	D	L	L	A	E	I	D	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?			?		?	?	?																																		?
Disorder confidence
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Sequence		S	Q	F	K	V	A	L	A	Q	A	Q	G	Q	L	A	K	D	K	A	T	L	A	N	A	R	R	D	L	A	R	Y	Q	Q	L	A	K	T	N	L	V	S	R	Q	E	L	D	A	Q	Q	A	L	V	S	E	T	E	G	T	I	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																						?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	D	E	A	S	V	A	S	A	Q	L	Q	L	D	W	S	R	I	T	A	P	V	D	G	R	V	G	L	K	Q	V	D	V	G	N	Q	I	S	S	G	D	T	T	G	I	V	V	I	T	Q	T	H	P	I	D	L	V	F	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?				?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		P	E	S	D	I	A	T	V	V	Q	A	Q	K	A	G	K	P	L	V	V	E	A	W	D	R	T	N	S	K	K	L	S	E	G	T	L	L	S	L	D	N	Q	I	D	A	T	T	G	T	I	K	V	K	A	R	F	N	N	Q	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?							?			?	?	?											?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	A	L	F	P	N	Q	F	V	N	A	R	M	L	V	D	T	E	Q	N	A	V	V	I	P	T	A	A	L	Q	M	G	N	E	G	H	F	V	W	V	L	N	S	E	N	K	V	S	K	H	L	V	T	P	G	I	Q	D	S	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?											?			?	?																										?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.
Sequence		K	V	V	I	R	A	G	I	S	A	G	D	R	V	V	T	D	G	I	D	R	L	T	E	G	A	K	V	E	V	V	E	A	Q	S	A	T	T	P	E	E	K	A	T	S	R	E	Y	A	K	K	G	A	R	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand