Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P39342 Date Thu Jan 5 11:59:31 GMT 2012 Unique Job ID a1e5789b51529c79

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	E	P	L	L	I	A	R	T	P	D	T	E	L	F	L	L	P	G	M	A	N	R	H	G	L	I	T	G	A	T	G	T	G	K	T	V	T	L	Q	K	L	A	E	S	L	S	E	I	G	V	P	V	F	M	A	D	V	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		G	D	L	T	G	V	A	Q	A	G	T	V	S	E	K	L	L	A	R	L	K	N	I	G	V	N	D	W	Q	P	H	A	N	P	V	V	V	W	D	I	F	G	E	K	G	H	P	V	R	A	T	V	S	D	L	G	P	L	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?																								?								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	R	L	L	N	L	N	D	V	Q	S	G	V	L	N	I	I	F	R	I	A	D	D	Q	G	L	L	L	L	D	F	K	D	L	R	A	I	T	Q	Y	I	G	D	N	A	K	S	F	Q	N	Q	Y	G	N	I	S	S	A	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?		?																																														?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	A	I	Q	R	G	L	L	S	L	E	Q	Q	G	A	A	H	F	F	G	E	P	M	L	D	I	K	D	W	M	R	T	D	A	N	G	K	G	V	I	N	I	L	S	A	E	K	L	Y	Q	M	P	K	L	Y	A	A	S	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?																		?											?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		W	M	L	S	E	L	Y	E	Q	L	P	E	A	G	D	L	E	K	P	K	L	V	F	F	F	D	E	A	H	L	L	F	N	D	A	P	Q	V	L	L	D	K	I	E	Q	V	I	R	L	I	R	S	K	G	V	G	V	W	F	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?	?																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	Q	N	P	S	D	I	P	D	N	V	L	G	Q	L	G	N	R	V	Q	H	A	L	R	A	F	T	P	K	D	Q	K	A	V	K	A	A	A	Q	T	M	R	A	N	P	A	F	D	T	E	K	A	I	Q	E	L	G	T	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?																																		?	?	?	?	?	?	?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	L	I	S	F	L	D	A	K	G	S	P	S	V	V	E	R	A	M	V	I	A	P	C	S	R	M	G	P	V	T	E	D	E	R	N	G	L	I	N	H	S	P	V	Y	G	K	Y	E	D	E	V	D	R	E	S	A	Y	E	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	Q	K	G	F	Q	A	S	T	E	Q	Q	N	N	P	P	A	K	G	K	E	V	A	V	D	D	G	I	L	G	G	L	K	D	I	L	F	G	T	T	G	P	R	G	G	K	K	D	G	V	V	Q	T	M	A	K	S	A	A	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
Sequence		Q	V	T	N	Q	I	V	R	G	M	L	G	S	L	L	G	G	R	R	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand