Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P33353 Date Thu Jan 5 11:51:54 GMT 2012 Unique Job ID a1ceb9407ef865e4

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	S	L	R	P	E	L	L	E	L	T	P	Q	A	L	T	A	L	S	N	A	G	F	V	K	R	S	L	K	E	L	E	N	G	N	V	P	E	I	S	H	E	N	D	A	L	I	A	T	F	S	D	G	V	R	T	Q	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																												?	?	?	?	?				?																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		N	G	Q	A	L	K	E	A	Q	C	S	C	G	A	N	G	M	C	R	H	R	V	M	L	V	L	S	Y	Q	R	L	C	A	T	T	Q	S	T	E	K	E	E	E	W	D	P	A	I	W	L	E	E	L	A	T	L	P	D	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?		?				?																							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?												?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	K	R	A	Q	A	L	V	A	K	G	I	T	I	E	L	F	C	A	P	G	E	I	P	S	A	R	L	P	M	S	D	V	R	F	Y	S	R	S	S	I	R	F	A	R	C	D	C	I	E	G	T	L	C	E	H	V	V	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?		?	?																						?	?		?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	Q	A	F	V	E	A	K	A	Q	Q	A	E	F	N	H	L	I	W	Q	M	R	S	E	H	V	T	S	S	D	D	P	F	A	S	E	E	G	N	A	C	R	Q	Y	V	Q	Q	L	S	Q	T	L	W	L	G	G	I	S	Q	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?		?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	I	H	Y	E	A	A	F	N	R	A	L	Q	A	A	E	T	C	N	W	R	W	V	S	E	S	L	R	Q	L	R	A	S	V	D	A	F	H	A	R	A	S	H	Y	N	A	G	E	C	L	H	Q	L	A	A	L	N	S	R	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?																					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		N	C	A	Q	E	M	A	R	R	D	S	I	G	E	V	P	P	V	P	W	R	T	V	V	G	S	G	I	A	G	E	A	K	L	D	H	L	R	L	V	S	L	G	M	R	C	W	Q	D	I	E	H	Y	G	L	R	I	W	F	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		D	P	D	T	G	S	I	L	H	L	S	R	S	W	P	R	S	E	Q	E	N	S	P	A	A	T	R	R	L	F	S	F	Q	A	G	A	L	A	G	G	Q	I	V	S	Q	A	A	K	R	S	A	D	G	E	L	L	L	A	T	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?		?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		N	R	L	S	S	V	V	P	L	S	P	D	A	W	Q	M	L	S	A	P	L	R	Q	P	G	I	V	A	L	R	E	Y	L	R	Q	R	P	P	A	C	I	R	P	L	N	Q	V	D	N	L	F	I	L	P	V	A	E	C	I	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?																					?	?	?				?															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		L	G	W	D	S	S	R	Q	T	L	D	A	Q	V	I	S	G	E	G	E	D	N	V	L	T	L	S	L	P	A	S	A	S	A	P	Y	A	V	E	R	M	A	A	L	L	Q	Q	T	D	D	P	V	C	L	V	S	G	F	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?			?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		F	V	E	G	Q	L	T	L	E	P	R	V	M	M	T	K	T	R	A	W	A	L	D	A	E	T	T	P	V	A	P	L	P	S	A	S	V	L	P	V	P	S	T	A	H	Q	L	L	I	R	C	Q	A	L	L	I	Q	L	L	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.
Sequence		N	G	W	R	Y	Q	E	Q	S	A	I	G	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand