Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P30871 Date Thu Jan 5 11:46:46 GMT 2012 Unique Job ID a12f3ea2bcde6bab

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	Q	E	I	E	L	K	F	I	V	N	H	S	A	V	E	A	L	R	D	H	L	N	T	L	G	G	E	H	H	D	P	V	Q	L	L	N	I	Y	Y	E	T	P	D	N	W	L	R	G	H	D	M	G	L	R	I	R	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																					?	?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		N	G	R	Y	E	M	T	M	K	V	A	G	R	V	T	G	G	L	H	Q	R	P	E	Y	N	V	A	L	S	E	P	T	L	D	L	A	Q	L	P	T	E	V	W	P	N	G	E	L	P	A	D	L	A	S	R	V	Q	P	L	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?		?																													?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	T	D	F	Y	R	E	K	W	L	V	A	V	D	G	S	Q	I	E	I	A	L	D	Q	G	E	V	K	A	G	E	F	A	E	P	I	C	E	L	E	L	E	L	L	S	G	D	T	R	A	V	L	K	L	A	N	Q	L	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Q	T	G	L	R	Q	G	S	L	S	K	A	A	R	G	Y	H	L	A	Q	G	N	P	A	R	E	I	K	P	T	T	I	L	H	V	A	A	K	A	D	V	E	Q	G	L	E	A	A	L	E	L	A	L	A	Q	W	Q	Y	H	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	L	W	V	R	G	N	D	A	A	K	E	Q	V	L	A	A	I	S	L	V	R	H	T	L	M	L	F	G	G	I	V	P	R	K	A	S	T	H	L	R	D	L	L	T	Q	C	E	A	T	I	A	S	A	V	S	A	V	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	Y	S	T	E	T	A	M	A	K	L	A	L	T	E	W	L	V	S	K	A	W	Q	P	F	L	D	A	K	A	Q	G	K	I	S	D	S	F	K	R	F	A	D	I	H	L	S	R	H	A	A	E	L	K	S	V	F	C	Q	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?					?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?																										?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	G	D	R	Y	R	D	Q	L	P	R	L	T	R	D	I	D	S	I	L	L	L	A	G	Y	Y	D	P	V	V	A	Q	A	W	L	E	N	W	Q	G	L	H	H	A	I	A	T	G	Q	R	I	E	I	E	H	F	R	N	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.
Sequence		N	N	Q	E	P	F	W	L	H	S	G	K	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand