Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P25798 Date Thu Jan 5 11:42:39 GMT 2012 Unique Job ID a0377b43ee3f9501

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	A	T	A	A	Q	T	K	S	L	E	W	L	N	R	L	R	A	N	P	K	I	P	L	I	V	A	G	S	A	A	V	A	V	M	V	A	L	I	L	W	A	K	A	P	D	Y	R	T	L	F	S	N	L	S	D	Q	D	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?													?		?		?	?																								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		G	A	I	V	S	Q	L	T	Q	M	N	I	P	Y	R	F	S	E	A	S	G	A	I	E	V	P	A	D	K	V	H	E	L	R	L	R	L	A	Q	Q	G	L	P	K	G	G	A	V	G	F	E	L	L	D	Q	E	K	F	G	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?						?	?	?																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	Q	F	S	E	Q	V	N	Y	Q	R	A	L	E	G	E	L	S	R	T	I	E	T	I	G	P	V	K	G	A	R	V	H	L	A	M	P	K	P	S	L	F	V	R	E	Q	K	S	P	S	A	S	V	T	V	N	L	L	P	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																						?	?	?	?	?	?	?										?	?	?	?	?	?	?	?	?											?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	A	L	D	E	G	Q	I	S	A	I	V	H	L	V	S	S	A	V	A	G	L	P	P	G	N	V	T	L	V	D	Q	G	G	H	L	L	T	Q	S	N	T	S	G	R	D	L	N	D	A	Q	L	K	Y	A	S	D	V	E	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		R	I	Q	R	R	I	E	A	I	L	S	P	I	V	G	N	G	N	I	H	A	Q	V	T	A	Q	L	D	F	A	S	K	E	Q	T	E	E	Q	Y	R	P	N	G	D	E	S	H	A	A	L	R	S	R	Q	L	N	E	S	E	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	G	S	G	Y	P	G	G	V	P	G	A	L	S	N	Q	P	A	P	A	N	N	A	P	I	S	T	P	P	A	N	Q	N	N	R	Q	Q	Q	A	S	T	T	S	N	S	G	P	R	S	T	Q	R	N	E	T	S	N	Y	E	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		D	R	T	I	R	H	T	K	M	N	V	G	D	V	Q	R	L	S	V	A	V	V	V	N	Y	K	T	L	P	D	G	K	P	L	P	L	S	N	E	Q	M	K	Q	I	E	D	L	T	R	E	A	M	G	F	S	E	K	R	G	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		S	L	N	V	V	N	S	P	F	N	S	S	D	E	S	G	G	E	L	P	F	W	Q	Q	Q	A	F	I	D	Q	L	L	A	A	G	R	W	L	L	V	L	L	V	A	W	L	L	W	R	K	A	V	R	P	Q	L	T	R	R	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		E	A	M	K	A	V	Q	Q	Q	A	Q	A	R	E	E	V	E	D	A	V	E	V	R	L	S	K	D	E	Q	L	Q	Q	R	R	A	N	Q	R	L	G	A	E	V	M	S	Q	R	I	R	E	M	S	D	N	D	P	R	V	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.
Sequence		L	V	I	R	Q	W	I	N	N	D	H	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand