Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P60293 Date Thu Jan 5 12:06:42 GMT 2012 Unique Job ID a019a1d350c80c18

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	E	F	S	Q	T	V	P	E	L	V	A	W	A	R	K	N	D	F	S	I	S	L	P	V	D	R	L	S	F	L	L	A	V	A	T	L	N	G	E	R	L	D	G	E	M	S	E	G	E	L	V	D	A	F	R	H	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?										?																					?				?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		D	A	F	E	Q	T	S	E	T	I	G	V	R	A	N	N	A	I	N	D	M	V	R	Q	R	L	L	N	R	F	T	S	E	Q	A	E	G	N	A	I	Y	R	L	T	P	L	G	I	G	I	T	D	Y	Y	I	R	Q	R	E	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?	?																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	T	L	R	L	S	M	Q	L	S	I	V	A	G	E	L	K	R	A	A	D	A	A	E	E	G	G	D	E	F	H	W	H	R	N	V	Y	A	P	L	K	Y	S	V	A	E	I	F	D	S	I	D	L	T	Q	R	L	M	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Q	Q	Q	Q	V	K	D	D	I	A	Q	L	L	N	K	D	W	R	A	A	I	S	S	C	E	L	L	L	S	E	T	S	G	T	L	R	E	L	Q	D	T	L	E	A	A	G	D	K	L	Q	A	N	L	L	R	I	Q	D	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		M	T	H	D	D	L	H	F	V	D	R	L	V	F	D	L	Q	S	K	L	D	R	I	I	S	W	G	Q	Q	S	I	D	L	W	I	G	Y	D	R	H	V	H	K	F	I	R	T	A	I	D	M	D	K	N	R	V	F	A	Q	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	R	Q	S	V	Q	T	Y	F	D	E	P	W	A	L	T	Y	A	N	A	D	R	L	L	D	M	R	D	E	E	M	A	L	R	D	E	E	V	T	G	E	L	P	E	D	L	E	Y	E	E	F	N	E	I	R	E	Q	L	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?																?					?	?	?			?	?		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	I	E	E	Q	L	A	V	Y	K	T	R	Q	V	P	L	D	L	G	L	V	V	R	E	Y	L	S	Q	Y	P	R	A	R	H	F	D	V	A	R	I	V	I	D	Q	A	V	R	L	G	V	A	Q	A	D	F	T	G	L	P	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?	?												?	?																	?	?	?			?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440
Sequence		K	W	Q	P	I	N	D	Y	G	A	K	V	Q	A	H	V	I	D	K	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?								?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand