Phyre 2 Results for P46889

Email	l.a.kelley@imperial.ac.uk
Description	P46889
Date	Wed Jan 25 15:20:57 GMT 2012
Unique Job ID	9ff5d5a8aaa0b07c

Secondary structure and disorder prediction

1 . . . . . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60

Sequence M S Q E Y I E D K E V T L T K L S S G R R L L E A L L I L I V L F A V W L M A A L L S F N P S D P S W S Q T A W H E P I

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ?
? ? ? ?
? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120

Sequence H N L G G M P G A W L A D T L F F I F G V M A Y T I P V I I V G G C W F A W R H Q S S D E Y I D Y F A V S L R I I G V L

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180

Sequence A L I L T S C G L A A I N A D D I W Y F A S G G V I G S L L S T T L Q P L L H S S G G T I A L L C V W A A G L T L F T G

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240

Sequence W S W V T I A E K L G G W I L N I L T F A S N R T R R D D T W V D E D E Y E D D E E Y E D E N H G K Q H E S R R A R I L

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300

Sequence R G A L A R R K R L A E K F I N P M G R Q T D A A L F S G K R M D D D E E I T Y T A R G V A A D P D D V L F S G N R A T

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350 . . . . . . . . . 360

Sequence Q P E Y D E Y D P L L N G A P I T E P V A V A A A A T T A T Q S W A A P V E P V T Q T P P V A S V D V P P A Q P T V A W

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420

Sequence Q P V P G P Q T G E P V I A P A P E G Y P Q Q S Q Y A Q P A V Q Y N E P L Q Q P V Q P Q Q P Y Y A P A A E Q P A Q Q P Y

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450 . . . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480

Sequence Y A P A P E Q P V A G N A W Q A E E Q Q S T F A P Q S T Y Q T E Q T Y Q Q P A A Q E P L Y Q Q P Q P V E Q Q P V V E P E

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 490 . . . . . . . . . 500 . . . . . . . . . 510 . . . . . . . . . 520 . . . . . . . . . 530 . . . . . . . . . 540

Sequence P V V E E T K P A R P P L Y Y F E E V E E K R A R E R E Q L A A W Y Q P I P E P V K E P E P I K S S L K A P S V A A V P

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 550 . . . . . . . . . 560 . . . . . . . . . 570 . . . . . . . . . 580 . . . . . . . . . 590 . . . . . . . . . 600

Sequence P V E A A A A V S P L A S G V K K A T L A T G A A A T V A A P V F S L A N S G G P R P Q V K E G I G P Q L P R P K R I R

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 610 . . . . . . . . . 620 . . . . . . . . . 630 . . . . . . . . . 640 . . . . . . . . . 650 . . . . . . . . . 660

Sequence V P T R R E L A S Y G I K L P S Q R A A E E K A R E A Q R N Q Y D S G D Q Y N D D E I D A M Q Q D E L A R Q F A Q T Q Q

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 670 . . . . . . . . . 680 . . . . . . . . . 690 . . . . . . . . . 700 . . . . . . . . . 710 . . . . . . . . . 720

Sequence Q R Y G E Q Y Q H D V P V N A E D A D A A A E A E L A R Q F A Q T Q Q Q R Y S G E Q P A G A N P F S L D D F E F S P M K

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 730 . . . . . . . . . 740 . . . . . . . . . 750 . . . . . . . . . 760 . . . . . . . . . 770 . . . . . . . . . 780

Sequence A L L D D G P H E P L F T P I V E P V Q Q P Q Q P V A P Q Q Q Y Q Q P Q Q P V P P Q P Q Y Q Q P Q Q P V A P Q P Q Y Q Q

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 790 . . . . . . . . . 800 . . . . . . . . . 810 . . . . . . . . . 820 . . . . . . . . . 830 . . . . . . . . . 840

Sequence P Q Q P V A P Q Q Q Y Q Q P Q Q P V A P Q Q Q Y Q Q P Q Q P V A P Q P Q D T L L H P L L M R N G D S R P L H K P T T P L

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 850 . . . . . . . . . 860 . . . . . . . . . 870 . . . . . . . . . 880 . . . . . . . . . 890 . . . . . . . . . 900

Sequence P S L D L L T P P P S E V E P V D T F A L E Q M A R L V E A R L A D F R I K A D V V N Y S P G P V I T R F E L N L A P G

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 910 . . . . . . . . . 920 . . . . . . . . . 930 . . . . . . . . . 940 . . . . . . . . . 950 . . . . . . . . . 960

Sequence V K A A R I S N L S R D L A R S L S T V A V R V V E V I P G K P Y V G L E L P N K K R Q T V Y L R E V L D N A K F R D N

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 970 . . . . . . . . . 980 . . . . . . . . . 990 . . . . . . . . . 1000 . . . . . . . . . 1010 . . . . . . . . . 1020

Sequence P S P L T V V L G K D I A G E P V V A D L A K M P H L L V A G T T G S G K S V G V N A M I L S M L Y K A Q P E D V R F I

Secondary structure

SS confidence

Disorder ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1030 . . . . . . . . . 1040 . . . . . . . . . 1050 . . . . . . . . . 1060 . . . . . . . . . 1070 . . . . . . . . . 1080

Sequence M I D P K M L E L S V Y E G I P H L L T E V V T D M K D A A N A L R W C V N E M E R R Y K L M S A L G V R N L A G Y N E

Secondary structure

SS confidence

Disorder

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1090 . . . . . . . . . 1100 . . . . . . . . . 1110 . . . . . . . . . 1120 . . . . . . . . . 1130 . . . . . . . . . 1140

Sequence K I A E A D R M M R P I P D P Y W K P G D S M D A Q H P V L K K E P Y I V V L V D E F A D L M M T V G K K V E E L I A R

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1150 . . . . . . . . . 1160 . . . . . . . . . 1170 . . . . . . . . . 1180 . . . . . . . . . 1190 . . . . . . . . . 1200

Sequence L A Q K A R A A G I H L V L A T Q R P S V D V I T G L I K A N I P T R I A F T V S S K I D S R T I L D Q A G A E S L L G

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ? ? ?
? ?
? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1210 . . . . . . . . . 1220 . . . . . . . . . 1230 . . . . . . . . . 1240 . . . . . . . . . 1250 . . . . . . . . . 1260

Sequence M G D M L Y S G P N S T L P V R V H G A F V R D Q E V H A V V Q D W K A R G R P Q Y V D G I T S D S E S E G G A G G F D

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1270 . . . . . . . . . 1280 . . . . . . . . . 1290 . . . . . . . . . 1300 . . . . . . . . . 1310 . . . . . . . . . 1320

Sequence G A E E L D P L F D Q A V Q F V T E K R K A S I S G V Q R Q F R I G Y N R A A R I I E Q M E A Q G I V S E Q G H N G N R

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ?
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . .

Sequence E V L A P P P F D

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

Confidence Key
High(9) Low (0)

? Disordered

Alpha helix

Beta strand