Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P37197 Date Thu Jan 5 11:55:03 GMT 2012 Unique Job ID 9df9369f98793b01

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	M	V	S	R	I	T	A	I	G	L	A	G	V	A	I	C	Y	L	G	L	S	G	Y	V	W	Y	H	D	N	K	R	S	K	Q	A	D	V	Q	A	S	A	V	S	E	N	N	K	V	L	G	F	L	R	E	K	G	C	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																					?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Y	C	H	T	P	S	A	E	L	P	A	Y	Y	Y	I	P	G	A	K	Q	L	M	D	Y	D	I	K	L	G	Y	K	S	F	N	L	E	A	V	R	A	A	L	L	A	D	K	P	V	S	Q	S	D	L	N	K	I	E	W	V	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Q	Y	E	T	M	P	P	T	R	Y	T	A	L	H	W	A	G	K	V	S	D	E	E	R	A	E	I	L	A	W	I	A	K	Q	R	A	E	Y	Y	A	S	N	D	T	A	P	E	H	R	N	E	P	V	Q	P	I	P	Q	K	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?													?		?	?		?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?			?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		P	T	D	A	Q	K	V	A	L	G	F	A	L	Y	H	D	P	R	L	S	A	D	S	T	I	S	C	A	H	C	H	A	L	N	A	G	G	V	D	G	R	K	T	S	I	G	V	G	G	A	V	G	P	I	N	A	P	T	V	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																		?	?	?	?									?		?	?	?	?			?				?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		N	S	V	F	N	V	E	Q	F	W	D	G	R	A	A	T	L	Q	D	Q	A	G	G	P	P	L	N	P	I	E	M	A	S	K	S	W	D	E	I	I	A	K	L	E	K	D	P	Q	L	K	T	Q	F	L	E	V	Y	P	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?																							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	S	G	E	N	I	T	D	A	I	A	E	F	E	K	T	L	I	T	P	D	S	P	F	D	K	W	L	R	G	D	E	N	A	L	T	A	Q	Q	K	K	G	Y	Q	L	F	K	D	N	K	C	A	T	C	H	G	G	I	I	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?	?	?																								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	G	R	S	F	E	P	L	G	L	K	K	D	F	N	F	G	E	I	T	A	A	D	I	G	R	M	N	V	T	K	E	E	R	D	K	L	R	Q	K	V	P	G	L	R	N	V	A	L	T	A	P	Y	F	H	R	G	D	V	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.
Sequence		T	L	D	G	A	V	K	L	M	L	R	Y	Q	V	G	K	E	L	P	Q	E	D	V	D	D	I	V	A	F	L	H	S	L	N	G	V	Y	T	P	Y	M	Q	D	K	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand