Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AFL6 Date Thu Jan 5 11:26:41 GMT 2012 Unique Job ID 9d167e7adf1fccc4

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	P	I	H	D	K	S	P	R	P	Q	E	F	A	A	V	D	L	G	S	N	S	F	H	M	V	I	A	R	V	V	D	G	A	M	Q	I	I	G	R	L	K	Q	R	V	H	L	A	D	G	L	G	P	D	N	M	L	S	E	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																											?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	M	T	R	G	L	N	C	L	S	L	F	A	E	R	L	Q	G	F	S	P	A	S	V	C	I	V	G	T	H	T	L	R	Q	A	L	N	A	T	D	F	L	K	R	A	E	K	V	I	P	Y	P	I	E	I	I	S	G	N	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	A	R	L	I	F	M	G	V	E	H	T	Q	P	E	K	G	R	K	L	V	I	D	I	G	G	G	S	T	E	L	V	I	G	E	N	F	E	P	I	L	V	E	S	R	R	M	G	C	V	S	F	A	Q	L	Y	F	P	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																											?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	I	N	K	E	N	F	Q	R	A	R	M	A	A	A	Q	K	L	E	T	L	T	W	Q	F	R	I	Q	G	W	N	V	A	M	G	A	S	G	T	I	K	A	A	H	E	V	L	M	E	M	G	E	K	D	G	I	I	T	P	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																																	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		R	L	E	K	L	V	K	E	V	L	R	H	R	N	F	A	S	L	S	L	P	G	L	S	E	E	R	K	T	V	F	V	P	G	L	A	I	L	C	G	V	F	D	A	L	A	I	R	E	L	R	L	S	D	G	A	L	R	E	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	L	Y	E	M	E	G	R	F	R	H	Q	D	V	R	S	R	T	A	S	S	L	A	N	Q	Y	H	I	D	S	E	Q	A	R	R	V	L	D	T	T	M	Q	M	Y	E	Q	W	R	E	Q	Q	P	K	L	A	H	P	Q	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?																																										?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	L	L	R	W	A	A	M	L	H	E	V	G	L	N	I	N	H	S	G	L	H	R	H	S	A	Y	I	L	Q	N	S	D	L	P	G	F	N	Q	E	Q	Q	L	M	M	A	T	L	V	R	Y	H	R	K	A	I	K	L	D	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																						?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	P	R	F	T	L	F	K	K	K	Q	F	L	P	L	I	Q	L	L	R	L	G	V	L	L	N	N	Q	R	Q	A	T	T	T	P	P	T	L	T	L	I	T	D	D	S	H	W	T	L	R	F	P	H	D	W	F	S	Q	N	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?		?	?																					?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.
Sequence		L	V	L	L	D	L	E	K	E	Q	E	Y	W	E	G	V	A	G	W	R	L	K	I	E	E	E	S	T	P	E	I	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand