Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P26365 Date Thu Jan 5 11:42:53 GMT 2012 Unique Job ID 9c86d3df803e8927

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	M	Y	R	I	R	N	W	L	V	A	T	L	L	L	L	C	T	P	V	G	A	A	T	L	S	D	I	Q	V	S	N	G	N	Q	Q	A	R	I	T	L	S	F	I	G	D	P	D	Y	A	F	S	H	Q	S	K	R	T	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?															?	?	?	?	?	?																								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	D	I	K	Q	T	G	V	I	Q	G	L	P	L	L	F	S	G	N	N	L	V	K	A	I	R	S	G	T	P	K	D	A	Q	T	L	R	L	V	V	D	L	T	E	N	G	K	T	E	A	V	K	R	Q	N	G	S	N	Y	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?				?													?	?	?	?	?	?			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	V	F	T	I	N	A	D	V	P	P	P	P	P	P	P	P	V	V	A	K	R	V	E	T	P	A	V	V	A	P	R	V	S	E	P	A	R	N	P	F	K	T	E	S	N	R	T	T	G	V	I	S	S	N	T	V	T	R	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	A	R	A	T	A	N	T	G	D	K	I	I	I	A	I	D	A	G	H	G	G	Q	D	P	G	A	I	G	P	G	G	T	R	E	K	N	V	T	I	A	I	A	R	K	L	R	T	L	L	N	D	D	P	M	F	K	G	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?															?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		T	R	D	G	D	Y	F	I	S	V	M	G	R	S	D	V	A	R	K	Q	N	A	N	F	L	V	S	I	H	A	D	A	A	P	N	R	S	A	T	G	A	S	V	W	V	L	S	N	R	R	A	N	S	E	M	A	S	W	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?	?													?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Q	H	E	K	Q	S	E	L	L	G	G	A	G	D	V	L	A	N	S	Q	S	D	P	Y	L	S	Q	A	V	L	D	L	Q	F	G	H	S	Q	R	V	G	Y	D	V	A	T	S	M	I	S	Q	L	Q	R	I	G	E	I	H	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																															?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		R	R	P	E	H	A	S	L	G	V	L	R	S	P	D	I	P	S	V	L	V	E	T	G	F	I	S	N	N	S	E	E	R	L	L	A	S	D	D	Y	Q	Q	Q	L	A	E	A	I	Y	K	G	L	R	N	Y	F	L	A	H	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?																																?	?																								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.
Sequence		M	Q	S	A	P	Q	G	A	T	A	Q	T	A	S	T	V	T	T	P	D	R	T	L	P	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand