Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0A935 Date Thu Jan 5 11:09:17 GMT 2012 Unique Job ID 9b849492960159dd

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	G	R	W	V	K	Y	L	L	M	G	T	V	V	A	M	L	A	A	C	S	S	K	P	T	D	R	G	Q	Q	Y	K	D	G	K	F	T	Q	P	F	S	L	V	N	Q	P	D	A	V	G	A	P	I	N	A	G	D	F	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	Q	I	N	H	I	R	N	S	S	P	R	L	Y	G	N	Q	S	N	V	Y	N	A	V	Q	E	W	L	R	A	G	G	D	T	R	N	M	R	Q	F	G	I	D	A	W	Q	M	E	G	A	D	N	Y	G	N	V	Q	F	T	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?	?	?	?											?																				?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Y	Y	T	P	V	I	Q	A	R	H	T	R	Q	G	E	F	Q	Y	P	I	Y	R	M	P	P	K	R	G	R	L	P	S	R	A	E	I	Y	A	G	A	L	S	D	K	Y	I	L	A	Y	S	N	S	L	M	D	N	F	I	M	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?																											?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	Q	G	S	G	Y	I	D	F	G	D	G	S	P	L	N	F	F	S	Y	A	G	K	N	G	H	A	Y	R	S	I	G	K	V	L	I	D	R	G	E	V	K	K	E	D	M	S	M	Q	A	I	R	H	W	G	E	T	H	S	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	E	V	R	E	L	L	E	Q	N	P	S	F	V	F	F	K	P	Q	S	F	A	P	V	K	G	A	S	A	V	P	L	V	G	R	A	S	V	A	S	D	R	S	I	I	P	P	G	T	T	L	L	A	E	V	P	L	L	D	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?	?																																?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		N	G	K	F	N	G	Q	Y	E	L	R	L	M	V	A	L	D	V	G	G	A	I	K	G	Q	H	F	D	I	Y	Q	G	I	G	P	E	A	G	H	R	A	G	W	Y	N	H	Y	G	R	V	W	V	L	K	T	A	P	G	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?	?																																																						?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.
Sequence		N	V	F	S	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand