Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0A7I4 Date Thu Jan 5 11:05:43 GMT 2012 Unique Job ID 9b678fdaaf472a2e

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	L	S	P	Y	L	Q	E	V	A	K	R	R	T	F	A	I	I	S	H	P	D	A	G	K	T	T	I	T	E	K	V	L	L	F	G	Q	A	I	Q	T	A	G	T	V	K	G	R	G	S	N	Q	H	A	K	S	D	W	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?						?																												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	M	E	K	Q	R	G	I	S	I	T	T	S	V	M	Q	F	P	Y	H	D	C	L	V	N	L	L	D	T	P	G	H	E	D	F	S	E	D	T	Y	R	T	L	T	A	V	D	C	C	L	M	V	I	D	A	A	K	G	V	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		D	R	T	R	K	L	M	E	V	T	R	L	R	D	T	P	I	L	T	F	M	N	K	L	D	R	D	I	R	D	P	M	E	L	L	D	E	V	E	N	E	L	K	I	G	C	A	P	I	T	W	P	I	G	C	G	K	L	F	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	V	Y	H	L	Y	K	D	E	T	Y	L	Y	Q	S	G	K	G	H	T	I	Q	E	V	R	I	V	K	G	L	N	N	P	D	L	D	A	A	V	G	E	D	L	A	Q	Q	L	R	D	E	L	E	L	V	K	G	A	S	N	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		F	D	K	E	L	F	L	A	G	E	I	T	P	V	F	F	G	T	A	L	G	N	F	G	V	D	H	M	L	D	G	L	V	E	W	A	P	A	P	M	P	R	Q	T	D	T	R	T	V	E	A	S	E	D	K	F	T	G	F	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	K	I	Q	A	N	M	D	P	K	H	R	D	R	V	A	F	M	R	V	V	S	G	K	Y	E	K	G	M	K	L	R	Q	V	R	T	A	K	D	V	V	I	S	D	A	L	T	F	M	A	G	D	R	S	H	V	E	E	A	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?																											?		?	?	?	?			?									?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		P	G	D	I	L	G	L	H	N	H	G	T	I	Q	I	G	D	T	F	T	Q	G	E	M	M	K	F	T	G	I	P	N	F	A	P	E	L	F	R	R	I	R	L	K	D	P	L	K	Q	K	Q	L	L	K	G	L	V	Q	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?		?	?	?															?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		E	E	G	A	V	Q	V	F	R	P	I	S	N	N	D	L	I	V	G	A	V	G	V	L	Q	F	D	V	V	V	A	R	L	K	S	E	Y	N	V	E	A	V	Y	E	S	V	N	V	A	T	A	R	W	V	E	C	A	D	A	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																										?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		K	F	E	E	F	K	R	K	N	E	S	Q	L	A	L	D	G	G	D	N	L	A	Y	I	A	T	S	M	V	N	L	R	L	A	Q	E	R	Y	P	D	V	Q	F	H	Q	T	R	E	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																				?					?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand