Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76237 Date Thu Jan 5 12:21:03 GMT 2012 Unique Job ID 9ae5447638bdf602

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	L	H	H	R	M	L	R	H	F	I	A	A	S	V	I	V	L	T	S	S	F	L	I	F	E	L	V	A	S	D	R	A	M	S	A	Y	L	R	Y	I	V	Q	K	A	D	S	S	F	L	Y	D	K	Y	Q	N	Q	S	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																											?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	A	H	V	M	R	A	L	A	A	E	Q	S	E	V	S	P	E	Q	R	R	A	I	C	E	A	F	E	S	A	N	N	T	H	G	L	N	L	T	A	H	K	Y	P	G	L	R	G	T	L	Q	T	A	S	T	D	C	D	T	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?	?	?	?													?		?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	E	A	A	A	L	L	P	A	F	D	Q	A	V	E	G	N	R	H	Q	D	D	Y	G	S	G	L	G	M	A	E	E	K	F	H	Y	Y	L	D	L	N	D	R	Y	V	Y	F	Y	E	P	V	N	V	E	Y	F	A	M	N	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?														?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		W	S	F	L	Q	S	G	S	I	G	I	D	R	K	D	I	E	K	V	F	T	G	R	T	V	L	S	S	I	Y	Q	D	Q	R	T	K	Q	N	V	M	S	L	L	T	P	V	Y	V	A	G	Q	L	K	G	I	V	L	L	D	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?					?	?	?		?	?	?	?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		N	K	N	N	L	R	N	I	F	Y	T	H	D	R	P	L	L	W	R	F	L	N	V	T	L	T	D	T	D	S	G	R	D	I	I	I	N	Q	S	E	D	N	L	F	Q	Y	V	S	Y	V	H	D	L	P	G	G	I	R	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?					?	?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	S	I	D	I	L	Y	F	I	T	S	S	W	K	S	V	L	F	W	I	L	T	A	L	I	L	L	N	M	V	R	M	H	F	R	L	Y	Q	N	V	S	R	E	N	I	S	D	A	M	T	G	L	Y	N	R	K	I	L	T	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	L	E	Q	R	L	Q	K	L	V	Q	S	G	S	S	V	M	F	I	A	I	D	M	D	K	L	K	Q	I	N	D	T	L	G	H	Q	E	G	D	L	A	I	T	L	L	A	Q	A	I	K	Q	S	I	R	K	S	D	Y	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		R	L	G	G	D	E	F	C	I	I	L	V	D	S	T	P	Q	I	A	A	Q	L	P	E	R	I	E	K	R	L	Q	H	I	A	P	Q	K	E	I	G	F	S	S	G	I	Y	A	M	K	E	N	D	T	L	H	D	A	Y	K	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.
Sequence		S	D	E	R	L	Y	V	N	K	Q	N	K	N	S	R	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand