Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P45464 Date Thu Jan 5 12:02:41 GMT 2012 Unique Job ID 9aa65b035587d68c

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	V	P	S	T	F	S	R	L	K	A	A	R	C	L	P	V	V	L	A	A	L	I	F	A	G	C	G	T	H	T	P	D	Q	S	T	A	Y	M	Q	G	T	A	Q	A	D	S	A	F	Y	L	Q	Q	M	Q	Q	S	S	D	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	R	I	N	W	Q	L	L	A	I	R	A	L	V	K	E	G	K	T	G	Q	A	V	E	L	F	N	Q	L	P	Q	E	L	N	D	A	Q	R	R	E	K	T	L	L	A	V	E	I	K	L	A	Q	K	D	F	A	G	A	Q	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?	?		?																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	L	A	K	I	T	P	A	D	L	E	Q	N	Q	Q	A	R	Y	W	Q	A	K	I	D	A	S	Q	G	R	P	S	I	D	L	L	R	A	L	I	A	Q	E	P	L	L	G	A	K	E	K	Q	Q	N	I	D	A	T	W	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?	?															?	?			?										?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	S	S	M	T	Q	E	Q	A	N	T	L	V	I	N	A	D	E	N	I	L	Q	G	W	L	D	L	Q	R	V	W	F	D	N	R	N	D	P	D	M	M	K	A	G	I	A	D	W	Q	K	R	Y	P	N	N	P	G	A	K	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?									?	?	?	?	?																?	?	?	?	?																			?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	P	T	Q	L	V	N	V	K	A	F	K	P	A	S	T	N	K	I	A	L	L	L	P	L	N	G	Q	A	A	V	F	G	R	T	I	Q	Q	G	F	E	A	A	K	N	I	G	T	Q	P	V	A	A	Q	V	A	A	A	P	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?									?	?	?	?	?		?												?	?	?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	D	V	A	E	Q	P	Q	P	Q	T	V	D	G	V	A	S	P	A	Q	A	S	V	S	D	L	T	G	E	Q	P	A	A	Q	P	V	P	V	S	A	P	A	T	S	T	A	A	V	S	A	P	A	N	P	S	A	E	L	K	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		Y	D	T	S	S	Q	P	L	S	Q	I	L	S	Q	V	Q	Q	D	G	A	S	I	V	V	G	P	L	L	K	N	N	V	E	E	L	L	K	S	N	T	P	L	N	V	L	A	L	N	Q	P	E	N	I	E	N	R	V	N	I	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		Y	F	A	L	S	P	E	D	E	A	R	D	A	A	R	H	I	R	D	Q	G	K	Q	A	P	L	V	L	I	P	R	S	S	L	G	D	R	V	A	N	A	F	A	Q	E	W	Q	K	L	G	G	G	T	V	L	Q	Q	K	F	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																							?	?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		S	T	S	E	L	R	A	G	V	N	G	G	S	G	I	A	L	T	G	S	P	I	T	L	R	A	T	T	D	S	G	M	T	T	N	N	P	T	L	Q	T	T	P	T	D	D	Q	F	T	N	N	G	G	R	V	D	A	V	Y	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		V	A	T	P	G	E	I	A	F	I	K	P	M	I	A	M	R	N	G	S	Q	S	G	A	T	L	Y	A	S	S	R	S	A	Q	G	T	A	G	P	D	F	R	L	E	M	E	G	L	Q	Y	S	E	I	P	M	L	A	G	G	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		L	P	L	M	Q	Q	A	L	S	A	V	N	N	D	Y	S	L	A	R	M	Y	A	M	G	V	D	A	W	S	L	A	N	H	F	S	Q	M	R	Q	V	Q	G	F	E	I	N	G	N	T	G	S	L	T	A	N	P	D	C	V	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?								?	?	?	?	?	?	?	?																					?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		N	R	N	L	S	W	L	Q	Y	Q	Q	G	Q	V	V	P	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?				?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand