Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P41036 Date Thu Jan 5 12:01:19 GMT 2012 Unique Job ID 9a25ac535133b65f

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	T	T	T	Q	N	I	P	W	Y	R	H	L	N	R	A	Q	W	R	A	F	S	A	A	W	L	G	Y	L	L	D	G	F	D	F	V	L	I	A	L	V	L	T	E	V	Q	G	E	F	G	L	T	T	V	Q	A	A	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																				?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		I	S	A	A	F	I	S	R	W	F	G	G	L	M	L	G	A	M	G	D	R	Y	G	R	R	L	A	M	V	T	S	I	V	L	F	S	A	G	T	L	A	C	G	F	A	P	G	Y	I	T	M	F	I	A	R	L	V	I	G	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	M	A	G	E	Y	G	S	S	A	T	Y	V	I	E	S	W	P	K	H	L	R	N	K	A	S	G	F	L	I	S	G	F	S	V	G	A	V	V	A	A	Q	V	Y	S	L	V	V	P	V	W	G	W	R	A	L	F	F	I	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	L	P	I	I	F	A	L	W	L	R	K	N	I	P	E	A	E	D	W	K	E	K	H	A	G	K	A	P	V	R	T	M	V	D	I	L	Y	R	G	E	H	R	I	A	N	I	V	M	T	L	A	A	A	T	A	L	W	F	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?	?	?											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		F	A	G	N	L	Q	N	A	A	I	V	A	V	L	G	L	L	C	A	A	I	F	I	S	F	M	V	Q	S	A	G	K	R	W	P	T	G	V	M	L	M	V	V	V	L	F	A	F	L	Y	S	W	P	I	Q	A	L	L	P	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Y	L	K	T	D	L	A	Y	N	P	H	T	V	A	N	V	L	F	F	S	G	F	G	A	A	V	G	C	C	V	G	G	F	L	G	D	W	L	G	T	R	K	A	Y	V	C	S	L	L	A	S	Q	L	L	I	I	P	V	F	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	G	G	A	N	V	W	V	L	G	L	L	L	F	F	Q	Q	M	L	G	Q	G	I	A	G	I	L	P	K	L	I	G	G	Y	F	D	T	D	Q	R	A	A	G	L	G	F	T	Y	N	V	G	A	L	G	G	A	L	A	P	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		I	G	A	L	I	A	Q	R	L	D	L	G	T	A	L	A	S	L	S	F	S	L	T	F	V	V	I	L	L	I	G	L	D	M	P	S	R	V	Q	R	W	L	R	P	E	A	L	R	T	H	D	A	I	D	G	K	P	F	S	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.
Sequence		A	V	P	F	G	S	A	K	N	D	L	V	K	T	K	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand