Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AEC0 Date Thu Jan 5 11:22:58 GMT 2012 Unique Job ID 99d255797485a949

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	F	L	M	D	P	S	I	W	A	G	L	L	T	L	V	V	L	E	I	V	L	G	I	D	N	L	V	F	I	A	I	L	A	D	K	L	P	P	K	Q	R	D	K	A	R	L	L	G	L	S	L	A	L	I	M	R	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	L	S	L	I	S	W	M	V	T	L	T	K	P	L	F	T	V	M	D	F	S	F	S	G	R	D	L	I	M	L	F	G	G	I	F	L	L	F	K	A	T	T	E	L	H	E	R	L	E	N	R	D	H	D	S	G	H	G	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	Y	A	S	F	W	V	V	V	T	Q	I	V	I	L	D	A	V	F	S	L	D	A	V	I	T	A	V	G	M	V	N	H	L	P	V	M	M	A	A	V	V	I	A	M	A	V	M	L	L	A	S	K	P	L	T	R	F	V	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Q	H	P	T	V	V	V	L	C	L	S	F	L	L	M	I	G	L	S	L	V	A	E	G	F	G	F	H	I	P	K	G	Y	L	Y	A	A	I	G	F	S	I	I	I	E	V	F	N	Q	I	A	R	R	N	F	I	R	H	Q	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																								?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		T	L	P	L	R	A	R	T	A	D	A	I	L	R	L	M	G	G	K	R	Q	A	N	V	Q	H	D	A	D	N	P	M	P	M	P	I	P	E	G	A	F	A	E	E	E	R	Y	M	I	N	G	V	L	T	L	A	S	R	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?														?	?	?	?	?															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		R	G	I	M	T	P	R	G	E	I	S	W	V	D	A	N	L	G	V	D	E	I	R	E	Q	L	L	S	S	P	H	S	L	F	P	V	C	R	G	E	L	D	E	I	I	G	I	V	R	A	K	E	L	L	V	A	L	E	E	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		V	D	V	A	A	I	A	S	A	S	P	A	I	I	V	P	E	T	L	D	P	I	N	L	L	G	V	L	R	R	A	R	G	S	F	V	I	V	T	N	E	F	G	V	V	Q	G	L	V	T	P	L	D	V	L	E	A	I	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		E	F	P	D	A	D	E	T	P	E	I	I	T	D	G	D	G	W	L	V	K	G	G	T	D	L	H	A	L	Q	Q	A	L	D	V	E	H	L	A	D	D	D	D	I	A	T	V	A	G	L	V	I	S	A	N	G	H	I	P	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		V	G	D	V	I	D	V	G	P	L	H	I	T	I	I	E	A	N	D	Y	R	V	D	L	V	R	I	V	K	E	Q	P	A	H	D	E	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand