Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0ABH9 Date Thu Jan 5 11:15:32 GMT 2012 Unique Job ID 992d3d4cec7d41b3

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	N	Q	E	L	E	L	S	L	N	M	A	F	A	R	A	R	E	H	R	H	E	F	M	T	V	E	H	L	L	L	A	L	L	S	N	P	S	A	R	E	A	L	E	A	C	S	V	D	L	V	A	L	R	Q	E	L	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		F	I	E	Q	T	T	P	V	L	P	A	S	E	E	E	R	D	T	Q	P	T	L	S	F	Q	R	V	L	Q	R	A	V	F	H	V	Q	S	S	G	R	N	E	V	T	G	A	N	V	L	V	A	I	F	S	E	Q	E	S	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	Y	L	L	R	K	H	E	V	S	R	L	D	V	V	N	F	I	S	H	G	T	R	K	D	E	P	T	Q	S	S	D	P	G	S	Q	P	N	S	E	E	Q	A	G	G	E	E	R	M	E	N	F	T	T	N	L	N	Q	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?		?	?											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	V	G	G	I	D	P	L	I	G	R	E	K	E	L	E	R	A	I	Q	V	L	C	R	R	R	K	N	N	P	L	L	V	G	E	S	G	V	G	K	T	A	I	A	E	G	L	A	W	R	I	V	Q	G	D	V	P	E	V	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?		?	?	?	?	?	?																	?																												?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	D	C	T	I	Y	S	L	D	I	G	S	L	L	A	G	T	K	Y	R	G	D	F	E	K	R	F	K	A	L	L	K	Q	L	E	Q	D	T	N	S	I	L	F	I	D	E	I	H	T	I	I	G	A	G	A	A	S	G	G	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?	?	?																																	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	D	A	A	N	L	I	K	P	L	L	S	S	G	K	I	R	V	I	G	S	T	T	Y	Q	E	F	S	N	I	F	E	K	D	R	A	L	A	R	R	F	Q	K	I	D	I	T	E	P	S	I	E	E	T	V	Q	I	I	N	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	K	P	K	Y	E	A	H	H	D	V	R	Y	T	A	K	A	V	R	A	A	V	E	L	A	V	K	Y	I	N	D	R	H	L	P	D	K	A	I	D	V	I	D	E	A	G	A	R	A	R	L	M	P	V	S	K	R	K	K	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?																			?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		V	N	V	A	D	I	E	S	V	V	A	R	I	A	R	I	P	E	K	S	V	S	Q	S	D	R	D	T	L	K	N	L	G	D	R	L	K	M	L	V	F	G	Q	D	K	A	I	E	A	L	T	E	A	I	K	M	A	R	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?																																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		L	G	H	E	H	K	P	V	G	S	F	L	F	A	G	P	T	G	V	G	K	T	E	V	T	V	Q	L	S	K	A	L	G	I	E	L	L	R	F	D	M	S	E	Y	M	E	R	H	T	V	S	R	L	I	G	A	P	P	G	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																																							?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		V	G	F	D	Q	G	G	L	L	T	D	A	V	I	K	H	P	H	A	V	L	L	L	D	E	I	E	K	A	H	P	D	V	F	N	I	L	L	Q	V	M	D	N	G	T	L	T	D	N	N	G	R	K	A	D	F	R	N	V	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		L	V	M	T	T	N	A	G	V	R	E	T	E	R	K	S	I	G	L	I	H	Q	D	N	S	T	D	A	M	E	E	I	K	K	I	F	T	P	E	F	R	N	R	L	D	N	I	I	W	F	D	H	L	S	T	D	V	I	H	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?		?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		V	V	D	K	F	I	V	E	L	Q	V	Q	L	D	Q	K	G	V	S	L	E	V	S	Q	E	A	R	N	W	L	A	E	K	G	Y	D	R	A	M	G	A	R	P	M	A	R	V	I	Q	D	N	L	K	K	P	L	A	N	E	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																						?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		L	F	G	S	L	V	D	G	G	Q	V	T	V	A	L	D	K	E	K	N	E	L	T	Y	G	F	Q	S	A	Q	K	H	K	A	E	A	A	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?																										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand