![]() |
| ||||||||||||||||||||||||
|   | Insertion relative to template |
|   | Deletion relative to template |
|   | Catalytic residue from the CSA |
|   | |
| Detailed help on interpreting your alignment | |
|   |   | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||
| Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Query Sequence |   | M | P | K | I | V | I | L | P | H | Q | D | L | C | P | D | G | A | V | L | E | A | N | S | G | E | T | I | L | D | A | A | L | R | N | G | I | E | . | I | E | H | A | C | E | K | S | C | A | C | T | T | C | H | C | I | V | R | E | G | F | . | D | S | L | P | E | S | S | E | Q | E | D | D | M | L | D | K | A | W | G |
| Template Sequence |   | M | A | K | I | N | F | V | D | H | T | G | . | . | . | E | T | R | T | V | E | V | E | E | G | A | T | V | M | E | A | A | I | R | N | A | I | P | G | V | E | A | E | C | G | G | A | C | A | C | A | T | C | H | V | Y | V | D | E | A | W | R | E | K | V | G | G | P | S | P | M | E | E | D | M | L | D | F | G | Y | D |
| Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | S | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | S | B | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | G | G | G | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | S | S | S | |||||||||||||
| Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 0 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | |||
|   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 79 | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Query Sequence |   | L | E | P | E | S | R | L | S | C | Q | A | R | V | T | D | . | . | E | D | L | V | V | E | I | P | R | Y | T | I | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Sequence |   | V | R | P | N | S | R | L | S | C | Q | I | K | V | S | N | E | L | D | G | L | I | V | T | T | P | E | R | Q | R | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Known Secondary structure |   | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | G | G | G | B | G | G | G | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 77 | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |
| Download: | Text version | FASTA pairwise alignment | 3D Model in PDB format |
Phyre is for academic use only
| Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
| Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
|   | ||||||||
|
| |||||||