Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0A7B1 Date Thu Jan 5 11:05:15 GMT 2012 Unique Job ID 98789f2b846547f3

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	G	Q	E	K	L	Y	I	E	K	E	L	S	W	L	S	F	N	E	R	V	L	Q	E	A	A	D	K	S	N	P	L	I	E	R	M	R	F	L	G	I	Y	S	N	N	L	D	E	F	Y	K	V	R	F	A	E	L	K	R	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		I	I	I	S	E	E	Q	G	S	N	S	H	S	R	H	L	L	G	K	I	Q	S	R	V	L	K	A	D	Q	E	F	D	G	L	Y	N	E	L	L	L	E	M	A	R	N	Q	I	F	L	I	N	E	R	Q	L	S	V	N	Q	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		N	W	L	R	H	Y	F	K	Q	Y	L	R	Q	H	I	T	P	I	L	I	N	P	D	T	D	L	V	Q	F	L	K	D	D	Y	T	Y	L	A	V	E	I	I	R	G	D	T	I	R	Y	A	L	L	E	I	P	S	D	K	V	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																															?	?												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	F	V	N	L	P	P	E	A	P	R	R	R	K	P	M	I	L	L	D	N	I	L	R	Y	C	L	D	D	I	F	K	G	F	F	D	Y	D	A	L	N	A	Y	S	M	K	M	T	R	D	A	E	Y	D	L	V	H	E	M	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	S	L	M	E	L	M	S	S	S	L	K	Q	R	L	T	A	E	P	V	R	F	V	Y	Q	R	D	M	P	N	A	L	V	E	V	L	R	E	K	L	T	I	S	R	Y	D	S	I	V	P	G	G	R	Y	H	N	F	K	D	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	N	F	P	N	V	G	K	A	N	L	V	N	K	P	L	P	R	L	R	H	I	W	F	D	K	A	Q	F	R	N	G	F	D	A	I	R	E	R	D	V	L	L	Y	Y	P	Y	H	T	F	E	H	V	L	E	L	L	R	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	F	D	P	S	V	L	A	I	K	I	N	I	Y	R	V	A	K	D	S	R	I	I	D	S	M	I	H	A	A	H	N	G	K	K	V	T	V	V	V	E	L	Q	A	R	F	D	E	E	A	N	I	H	W	A	K	R	L	T	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		A	G	V	H	V	I	F	S	A	P	G	L	K	I	H	A	K	L	F	L	I	S	R	K	E	N	G	E	V	V	R	Y	A	H	I	G	T	G	N	F	N	E	K	T	A	R	L	Y	T	D	Y	S	L	L	T	A	D	A	R	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		T	N	E	V	R	R	V	F	N	F	I	E	N	P	Y	R	P	V	T	F	D	Y	L	M	V	S	P	Q	N	S	R	R	L	L	Y	E	M	V	D	R	E	I	A	N	A	Q	Q	G	L	P	S	G	I	T	L	K	L	N	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?																															?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		V	D	K	G	L	V	D	R	L	Y	A	A	S	S	S	G	V	P	V	N	L	L	V	R	G	M	C	S	L	I	P	N	L	E	G	I	S	D	N	I	R	A	I	S	I	V	D	R	Y	L	E	H	D	R	V	Y	I	F	E	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		G	G	D	K	K	V	Y	L	S	S	A	D	W	M	T	R	N	I	D	Y	R	I	E	V	A	T	P	L	L	D	P	R	L	K	Q	R	V	L	D	I	I	D	I	L	F	S	D	T	V	K	A	R	Y	I	D	K	E	L	S	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		R	Y	V	P	R	G	N	R	R	K	V	R	A	Q	L	A	I	Y	D	Y	I	K	S	L	E	Q	P	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?												?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand