Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P37443 Date Thu Jan 5 11:55:38 GMT 2012 Unique Job ID 981abe20ffaa131c

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	I	T	T	V	G	V	C	I	I	S	G	I	F	P	L	L	I	L	P	Q	L	P	G	T	L	T	L	A	F	L	T	L	F	A	C	V	L	A	F	I	P	V	K	T	V	R	Y	I	A	L	T	L	L	F	F	V	W	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		I	L	S	A	K	Q	I	L	W	A	G	E	T	L	T	G	A	T	Q	D	A	I	V	E	I	T	A	T	D	G	M	T	T	H	Y	G	Q	I	T	H	L	Q	G	R	R	I	F	P	A	S	G	L	V	M	Y	G	E	Y	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?								?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?									?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Q	A	V	C	A	G	Q	Q	W	S	M	K	L	K	V	R	A	V	H	G	Q	L	N	D	G	G	F	D	S	Q	R	Y	A	I	A	Q	H	Q	P	L	T	G	R	F	L	Q	A	S	V	I	E	P	N	C	S	L	R	A	Q	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?	?	?	?																						?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	A	S	L	Q	T	T	L	Q	P	Y	P	W	N	A	V	I	L	G	L	G	M	G	E	R	L	S	V	P	K	E	I	K	N	I	M	R	D	T	G	T	A	H	L	M	A	I	S	G	L	H	I	A	F	A	A	L	L	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	L	I	R	S	G	Q	I	F	L	P	G	R	W	I	H	W	Q	I	P	L	I	G	G	I	C	C	A	A	F	Y	A	W	L	T	G	M	Q	P	P	A	L	R	T	M	V	A	L	A	T	W	G	M	L	K	L	S	G	R	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?		?																																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		W	S	G	W	D	V	W	I	C	C	L	A	A	I	L	L	M	D	P	V	A	I	L	S	Q	S	L	W	L	S	A	A	A	V	A	A	L	I	F	W	Y	Q	W	F	P	C	P	E	W	Q	L	P	P	V	L	R	A	V	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	I	H	L	Q	L	G	I	T	L	L	L	M	P	V	Q	I	V	I	F	H	G	I	S	L	T	S	F	I	A	N	L	L	A	I	P	L	V	T	F	I	T	V	P	L	I	L	A	A	M	V	V	H	L	S	G	P	L	I	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		E	Q	G	L	W	F	L	A	D	R	S	L	A	L	L	F	W	G	L	K	S	L	P	E	G	W	I	N	I	A	E	C	W	Q	W	L	S	F	S	P	W	F	L	L	V	V	W	R	L	N	A	W	R	T	L	P	A	M	C	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		A	G	G	L	L	M	C	W	P	L	W	Q	K	P	R	P	D	E	W	Q	L	Y	M	L	D	V	G	Q	G	L	A	M	V	I	A	R	N	G	K	A	I	L	Y	D	T	G	L	A	W	P	E	G	D	S	G	Q	Q	L	I	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		P	W	L	H	W	H	N	L	E	P	E	G	V	I	L	S	H	E	H	L	D	H	R	G	G	L	D	S	I	L	H	I	W	P	M	L	W	I	R	S	P	L	N	W	E	H	H	Q	P	C	V	R	G	E	A	W	Q	W	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																														?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		L	R	F	S	A	H	W	P	L	Q	G	S	N	D	K	G	N	N	H	S	C	V	V	K	V	D	D	G	T	N	S	I	L	L	T	G	D	I	E	A	P	A	E	Q	K	M	L	S	R	Y	W	Q	Q	V	Q	A	T	L	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		V	P	H	H	G	S	N	T	S	S	S	L	P	L	I	Q	R	V	N	G	K	V	A	L	A	S	A	S	R	Y	N	A	W	R	L	P	S	N	K	V	K	H	R	Y	Q	L	Q	G	Y	Q	W	I	D	T	P	H	Q	G	Q	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.
Sequence		T	V	N	F	S	A	Q	G	W	R	I	S	S	L	R	E	Q	I	L	P	R	W	Y	H	Q	W	F	G	V	P	V	D	N	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand