Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76473 Date Thu Jan 5 12:23:18 GMT 2012 Unique Job ID 97e9d0b188fbdcfc

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	S	V	R	Y	L	I	G	L	F	A	F	I	A	C	Y	Y	L	L	P	I	S	T	R	L	L	W	Q	P	D	E	T	R	Y	A	E	I	S	R	E	M	L	A	S	G	D	W	I	V	P	H	L	L	G	L	R	Y	F	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	P	I	A	G	Y	W	I	N	S	I	G	Q	W	L	F	G	A	N	N	F	G	V	R	A	G	V	I	F	A	T	L	L	T	A	A	L	V	T	W	F	T	L	R	L	W	R	D	K	R	L	A	L	L	A	T	V	I	Y	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	L	F	I	V	Y	A	I	G	T	Y	A	V	L	D	P	F	I	A	F	W	L	V	A	G	M	C	S	F	W	L	A	M	Q	A	Q	T	W	K	G	K	S	A	G	F	L	L	L	G	I	T	C	G	M	G	V	M	T	K	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	L	A	L	A	V	P	V	L	S	V	L	P	W	V	A	T	Q	K	R	W	K	D	L	F	I	Y	G	W	L	A	V	I	S	C	V	L	T	V	L	P	W	G	L	A	I	A	Q	R	E	P	N	F	W	H	Y	F	F	W	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	H	I	Q	R	F	A	L	D	D	A	Q	H	R	A	P	F	W	Y	Y	V	P	V	I	I	A	G	S	L	P	W	L	G	L	L	P	G	A	L	Y	T	G	W	K	N	R	K	H	S	A	T	V	Y	L	L	S	W	T	I	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		P	L	L	F	F	S	V	A	K	G	K	L	P	T	Y	I	L	S	C	F	A	S	L	A	M	L	M	A	H	Y	A	L	L	A	A	K	N	N	P	L	A	L	R	I	N	G	W	I	N	I	A	F	G	V	T	G	I	I	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		F	V	V	S	P	W	G	P	M	N	T	P	V	W	Q	T	F	E	S	Y	K	V	F	C	A	W	S	I	F	S	L	W	A	F	F	G	W	Y	T	L	T	N	V	E	K	T	W	P	F	A	A	L	C	P	L	G	L	A	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?			?	?	?																											?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		V	G	F	S	I	P	D	R	V	M	E	G	K	H	P	Q	F	F	V	E	M	T	Q	E	S	L	Q	P	S	R	Y	I	L	T	D	S	V	G	V	A	A	G	L	A	W	S	L	Q	R	D	D	I	I	M	Y	R	Q	T	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		L	K	Y	G	L	N	Y	P	D	A	K	G	R	F	V	S	G	D	E	F	A	N	W	L	N	Q	H	R	Q	E	G	I	I	T	L	V	L	S	V	D	R	D	E	D	I	N	S	L	A	I	P	P	A	D	A	I	D	R	Q	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?		?				?	?																									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550
Sequence		R	L	V	L	I	Q	Y	R	P	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand