Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q47688 Date Thu Jan 5 12:37:02 GMT 2012 Unique Job ID 977151d8ec013e8f

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	Q	R	K	L	A	T	W	A	A	T	D	P	S	L	R	I	Q	R	L	L	R	L	I	T	Q	P	E	W	L	A	E	A	A	R	I	T	L	S	S	K	G	A	H	T	P	G	V	D	G	V	N	K	T	M	L	Q	A	R	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?								?	?	?	?	?	?																							?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	V	E	L	Q	I	L	R	D	E	L	L	S	G	H	Y	Q	P	L	P	A	R	R	V	Y	I	P	K	S	N	G	K	L	R	P	L	G	I	P	A	L	R	D	R	I	V	Q	R	A	M	L	M	A	M	E	P	I	W	E	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		D	F	H	T	L	S	Y	G	F	R	P	E	R	S	V	H	H	A	I	R	T	V	K	L	Q	L	T	D	C	G	E	T	R	G	R	W	V	I	E	G	D	L	S	S	Y	F	D	T	V	H	H	R	L	L	M	K	A	V	R	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	I	S	D	A	R	F	M	T	L	L	W	K	T	I	K	A	G	H	I	D	V	G	L	F	R	A	A	S	E	G	V	P	Q	G	G	V	I	S	P	L	L	S	N	I	M	L	N	E	F	D	Q	Y	L	H	E	R	Y	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?																																									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	K	A	R	K	D	R	W	Y	W	N	N	S	I	Q	R	G	R	S	T	A	V	R	E	N	W	Q	W	K	P	A	V	A	Y	C	R	Y	A	D	D	F	V	L	I	V	K	G	T	K	A	Q	V	E	A	I	R	E	E	C	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	V	L	E	G	S	L	K	L	R	L	N	M	D	K	T	K	I	P	H	V	N	D	G	F	I	F	L	G	H	R	L	I	R	K	R	S	R	Y	G	E	M	R	V	V	S	T	I	P	Q	E	K	A	R	N	F	A	A	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?				?	?	?	?				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
Sequence		T	A	L	L	W	K	V	R	I	S	G	E	I	L	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand