Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P45848 Date Thu Jan 5 12:03:51 GMT 2012 Unique Job ID 93f9ac25c7956663

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	G	K	F	R	C	I	L	L	L	I	A	G	L	F	V	S	S	L	S	Y	A	E	N	T	E	I	P	S	Y	E	E	G	I	S	L	F	D	V	E	A	T	L	Q	P	D	G	V	L	D	I	K	E	N	I	H	F	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	N	Q	Q	I	K	H	G	F	Y	R	D	L	P	R	L	W	M	Q	P	D	G	D	A	A	L	L	N	Y	H	I	V	G	V	T	R	D	G	I	P	E	P	W	H	L	D	W	H	I	G	L	M	S	I	V	V	G	D	K	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?	?	?	?																						?											?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	F	L	P	Q	G	D	Y	H	Y	Q	I	H	Y	Q	V	K	N	A	F	L	R	E	G	D	S	D	L	L	I	W	N	V	T	G	N	H	W	P	F	E	I	Y	K	T	R	F	S	L	Q	F	S	N	I	A	G	N	P	F	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																																				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	I	D	L	F	T	G	E	E	G	D	T	Y	R	N	G	R	I	L	E	D	G	R	I	E	S	R	D	P	F	Y	R	E	D	F	T	V	L	Y	R	W	P	H	A	L	L	S	N	A	S	A	P	Q	T	T	N	I	F	S	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?														?	?																							?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	L	L	P	S	T	S	S	L	L	I	W	F	P	C	L	F	L	V	C	G	W	L	Y	L	W	K	R	R	P	Q	F	T	P	V	D	V	I	E	T	D	V	I	P	P	D	Y	T	P	G	M	L	R	L	D	A	K	L	V	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?																			?		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	D	K	G	F	C	A	D	I	V	N	L	I	V	K	G	K	I	H	L	E	D	Q	S	D	K	N	Q	Q	I	L	I	R	V	N	E	G	A	T	R	N	N	A	V	L	L	P	A	E	Q	L	L	L	E	A	L	F	R	K	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?			?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		D	K	V	V	L	T	G	R	R	N	R	V	L	R	R	A	F	L	R	M	Q	K	F	Y	L	P	R	K	K	S	S	F	Y	R	S	D	T	F	L	Q	W	G	G	L	A	I	L	A	V	I	L	Y	G	N	L	S	P	V	G	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?							?	?	?	?																	?	?	?								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		A	G	M	S	L	V	G	D	M	F	I	M	I	C	W	I	I	P	F	L	F	C	S	L	E	L	L	F	A	R	D	D	D	K	P	C	V	N	R	V	I	I	T	L	F	L	P	L	I	C	S	G	V	A	F	Y	S	L	Y	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		N	V	G	D	V	F	F	Y	W	Y	M	P	A	G	Y	F	T	A	V	C	L	T	G	Y	L	T	G	M	G	Y	I	F	L	P	K	F	T	Q	T	G	Q	Q	R	Y	A	H	G	E	A	I	V	N	Y	L	A	R	K	E	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?																											?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		T	H	S	G	R	R	R	K	G	E	T	R	K	L	D	Y	A	L	L	G	W	A	I	S	A	N	L	G	R	E	W	A	L	R	I	A	P	S	L	S	S	A	I	R	A	P	E	I	A	R	N	G	V	L	F	S	L	Q	T	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?																																	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.
Sequence		L	S	C	G	A	N	T	S	L	L	G	R	S	Y	S	G	G	G	A	G	G	G	A	G	G	G	G	G	G	G	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand