Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77804 Date Thu Jan 5 12:32:59 GMT 2012 Unique Job ID 932326283466f949

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	K	S	L	V	A	V	G	V	I	V	A	L	G	V	V	W	T	G	G	A	W	Y	T	G	K	K	I	E	T	H	L	E	D	M	V	A	Q	A	N	A	Q	L	K	L	T	A	P	E	S	N	L	E	V	S	Y	Q	N	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																																										?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		H	R	G	V	F	S	S	Q	L	Q	L	L	V	K	P	I	A	G	K	E	N	P	W	I	K	S	G	Q	S	V	I	F	N	E	S	V	D	H	G	P	F	P	L	A	Q	L	K	K	L	N	L	I	P	S	M	A	S	I	Q	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																			?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	L	V	N	N	E	V	S	K	P	L	F	D	M	A	K	G	E	T	P	F	E	I	N	S	R	I	G	Y	S	G	D	S	S	S	D	I	S	L	K	P	L	N	Y	E	Q	K	D	E	K	V	A	F	S	G	G	E	F	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		N	A	D	R	D	G	K	A	I	S	L	S	G	E	A	Q	S	G	R	I	D	A	V	N	E	Y	N	Q	K	V	Q	L	T	F	N	N	L	K	T	D	G	S	S	T	L	A	S	F	G	E	R	V	G	N	Q	K	L	S	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?	?	?	?	?	?	?	?							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	M	T	I	S	V	E	G	K	E	L	A	L	L	E	G	M	E	I	S	G	K	S	D	L	V	N	D	G	K	T	I	N	S	Q	L	D	Y	S	L	N	S	L	K	V	Q	N	Q	D	L	G	S	G	K	L	T	L	K	V	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?						?		?	?					?	?	?	?		?																		?		?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Q	I	D	G	E	A	W	H	Q	F	S	Q	Q	Y	N	A	Q	T	Q	A	L	L	A	Q	P	E	I	A	N	N	P	E	L	Y	Q	E	K	V	T	E	A	F	F	S	A	L	P	L	M	L	K	G	D	P	V	I	T	I	A	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?	?	?	?	?	?	?	?																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	S	W	K	N	S	Q	G	E	S	A	L	N	L	S	L	F	L	K	D	P	A	T	T	K	E	A	P	Q	T	L	A	Q	E	V	D	R	S	V	K	S	L	D	A	K	L	T	I	P	V	D	M	A	T	E	F	M	T	Q	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?		?	?												?	?	?	?	?	?	?	?												?	?	?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		A	K	L	E	G	Y	Q	E	D	Q	A	K	K	L	A	K	Q	Q	V	E	G	A	S	A	M	G	Q	M	F	R	L	T	T	L	Q	D	N	T	I	T	T	S	L	Q	Y	A	N	G	Q	I	T	L	N	G	Q	K	M	S	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?																					?	?	?																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.
Sequence		D	F	V	G	M	F	A	M	P	A	L	N	V	P	A	V	P	A	I	P	Q	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand