Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P62558 Date Thu Jan 5 12:07:38 GMT 2012 Unique Job ID 92bc367d5abf48be

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	R	A	P	V	I	P	K	H	T	L	N	T	Q	P	V	E	D	T	S	L	S	T	P	A	A	P	M	V	D	S	L	I	A	R	V	G	V	M	A	R	G	N	A	I	T	L	P	V	C	G	R	D	V	K	F	T	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	L	R	G	D	S	V	E	K	T	S	R	V	W	S	G	N	E	R	D	Q	E	L	L	T	E	D	A	L	D	D	L	I	P	S	F	L	L	T	G	Q	Q	T	P	A	F	G	R	R	V	S	G	V	I	E	I	A	D	G	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?				?	?	?	?	?	?					?			?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	R	R	K	A	A	A	L	T	E	S	D	Y	R	V	L	V	G	E	L	D	D	E	Q	M	A	A	L	S	R	L	G	N	D	Y	R	P	T	S	A	Y	E	R	G	Q	R	Y	A	S	R	L	Q	N	E	F	A	G	N	I	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	L	A	D	A	E	N	I	S	R	K	I	I	T	R	C	I	N	T	A	K	L	P	K	S	V	V	A	L	F	S	H	P	G	E	L	S	A	R	S	G	D	A	L	Q	K	A	F	T	D	K	E	E	L	L	K	Q	Q	A	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?	?	?	?													?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		N	L	H	E	Q	K	K	A	G	V	I	F	E	A	E	E	V	I	T	L	L	T	S	V	L	K	T	S	S	A	S	R	T	S	L	S	S	R	H	Q	F	A	P	G	A	T	V	L	Y	K	G	D	K	M	V	L	N	L	D	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?	?	?										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
Sequence		S	R	V	P	T	E	C	I	E	K	I	E	A	I	L	K	E	L	E	K	P	A	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?														?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand