Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P24241 Date Thu Jan 5 11:41:33 GMT 2012 Unique Job ID 92a625dc854ea0d0

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	K	N	Y	A	A	L	A	R	S	V	I	A	A	L	G	G	V	D	N	I	S	A	V	T	H	C	M	T	R	L	R	F	V	I	K	D	D	A	L	I	D	S	P	T	L	K	T	I	P	G	V	L	G	V	V	R	S	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		N	Q	C	Q	V	I	I	G	N	T	V	S	Q	A	F	Q	E	V	V	S	L	L	P	G	D	M	Q	P	A	Q	P	V	G	K	P	K	L	T	L	R	R	I	G	A	G	I	L	D	A	L	I	G	T	M	S	P	L	I	P	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	I	G	G	S	M	V	K	L	L	A	M	I	L	E	M	S	G	V	L	T	K	G	S	P	T	L	T	I	L	N	V	I	G	D	G	A	F	F	F	L	P	L	M	V	A	A	S	A	A	I	K	F	K	T	N	M	S	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	A	I	A	G	V	L	V	H	P	S	F	I	E	L	M	A	K	A	A	Q	G	E	H	V	E	F	A	L	I	P	V	T	A	V	K	Y	T	Y	T	V	I	P	A	L	V	M	T	W	C	L	S	Y	I	E	R	W	V	D	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?		?												?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	T	P	A	V	T	K	N	F	L	K	P	M	L	I	V	L	I	A	A	P	L	A	I	L	L	I	G	P	I	G	I	W	I	G	S	A	I	S	A	L	V	Y	T	I	H	G	Y	L	G	W	L	S	V	A	I	M	G	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		W	P	L	L	V	M	T	G	M	H	R	V	F	T	P	T	I	I	Q	T	I	A	E	T	G	K	E	G	M	V	M	P	S	E	I	G	A	N	L	S	L	G	G	S	S	L	A	V	A	W	K	T	K	N	P	E	L	R	Q	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	L	A	A	A	A	S	A	I	M	A	G	I	S	E	P	A	L	Y	G	V	A	I	R	L	K	R	P	L	I	A	S	L	I	S	G	F	I	C	G	A	V	A	G	M	A	G	L	A	S	H	S	M	A	A	P	G	L	F	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																	?																													?			?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		S	V	Q	F	F	D	P	A	N	P	M	S	I	V	W	V	F	A	V	M	A	L	A	V	V	L	S	F	I	L	T	L	L	L	G	F	E	D	I	P	V	E	E	A	A	A	Q	A	R	K	Y	Q	S	V	Q	P	T	V	A	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?																																	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.
Sequence		E	V	S	L	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand