Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AFF0 Date Thu Jan 5 11:26:04 GMT 2012 Unique Job ID 9176c9f773beec16

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	I	T	P	Q	N	L	I	A	L	L	P	L	L	I	V	G	L	T	V	V	V	V	M	L	S	I	A	W	R	R	N	H	F	L	N	A	T	L	S	V	I	G	L	N	A	A	L	V	S	L	W	F	V	G	Q	A	G	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																									?		?	?																										?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		M	D	V	T	P	L	M	R	V	D	G	F	A	M	L	Y	T	G	L	V	L	L	A	S	L	A	T	C	T	F	A	Y	P	W	L	E	G	Y	N	D	N	K	D	E	F	Y	L	L	V	L	I	A	A	L	G	G	I	L	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		N	A	N	H	L	A	S	L	F	L	G	I	E	L	I	S	L	P	L	F	G	L	V	G	Y	A	F	R	Q	K	R	S	L	E	A	S	I	K	Y	T	I	L	S	A	A	A	S	S	F	L	L	F	G	M	A	L	V	Y	A	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	G	D	L	S	F	V	A	L	G	K	N	L	G	D	G	M	L	N	E	P	L	L	L	A	G	F	G	L	M	I	V	G	L	G	F	K	L	S	L	V	P	F	H	L	W	T	P	D	V	Y	Q	G	A	P	A	P	V	S	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		F	L	A	T	A	S	K	I	A	I	F	G	V	V	M	R	L	F	L	Y	A	P	V	G	D	S	E	A	I	R	V	V	L	A	I	I	A	F	A	S	I	I	F	G	N	L	M	A	L	S	Q	T	N	I	K	R	L	L	G	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	S	I	S	H	L	G	Y	L	L	V	A	L	I	A	L	Q	T	G	E	M	S	M	E	A	V	G	V	Y	L	A	G	Y	L	F	S	S	L	G	A	F	G	V	V	S	L	M	S	S	P	Y	R	G	P	D	A	D	S	L	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?		?	?	?																													?		?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	Y	R	G	L	F	W	H	R	P	I	L	A	A	V	M	T	V	M	M	L	S	L	A	G	I	P	M	T	L	G	F	I	G	K	F	Y	V	L	A	V	G	V	Q	A	H	L	W	W	L	V	G	A	V	V	V	G	S	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	L	Y	Y	Y	L	R	V	A	V	S	L	Y	L	H	A	P	E	Q	P	G	R	D	A	P	S	N	W	Q	Y	S	A	G	G	I	V	V	L	I	S	A	L	L	V	L	V	L	G	V	W	P	Q	P	L	I	S	I	V	R	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.
Sequence		A	M	P	L	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand