Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0ABC9 Date Thu Jan 5 11:15:11 GMT 2012 Unique Job ID 90a3e5b1521bb13f

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	D	L	S	H	S	R	E	K	D	K	I	N	P	V	V	F	Y	T	S	A	G	L	I	L	L	F	S	L	T	T	I	L	F	R	D	F	S	A	L	W	I	G	R	T	L	D	W	V	S	K	T	F	G	W	Y	Y	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	A	T	L	Y	I	V	F	V	V	C	I	A	C	S	R	F	G	S	V	K	L	G	P	E	Q	S	K	P	E	F	S	L	L	S	W	A	A	M	L	F	A	A	G	I	G	I	D	L	M	F	F	S	V	A	E	P	V	T	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Y	M	Q	P	P	E	G	A	G	Q	T	I	E	A	A	R	Q	A	M	V	W	T	L	F	H	Y	G	L	T	G	W	S	M	Y	A	L	M	G	M	A	L	G	Y	F	S	Y	R	Y	N	L	P	L	T	I	R	S	A	L	Y	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?																																											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	F	G	K	R	I	N	G	P	I	G	H	S	V	D	I	A	A	V	I	G	T	I	F	G	I	A	T	T	L	G	I	G	V	V	Q	L	N	Y	G	L	S	V	L	F	D	I	P	D	S	M	A	A	K	A	A	L	I	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	V	I	I	A	T	I	S	V	T	S	G	V	D	K	G	I	R	V	L	S	E	L	N	V	A	L	A	L	G	L	I	L	F	V	L	F	M	G	D	T	S	F	L	L	N	A	L	V	L	N	V	G	D	Y	V	N	R	F	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	M	T	L	N	S	F	A	F	D	R	P	V	E	W	M	N	N	W	T	L	F	F	W	A	W	W	V	A	W	S	P	F	V	G	L	F	L	A	R	I	S	R	G	R	T	I	R	Q	F	V	L	G	T	L	I	I	P	F	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		F	T	L	L	W	L	S	V	F	G	N	S	A	L	Y	E	I	I	H	G	G	A	A	F	A	E	E	A	M	V	H	P	E	R	G	F	Y	S	L	L	A	Q	Y	P	A	F	T	F	S	A	S	V	A	T	I	T	G	L	L	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?		?		?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		Y	V	T	S	A	D	S	G	A	L	V	L	G	N	F	T	S	Q	L	K	D	I	N	S	D	A	P	G	W	L	R	V	F	W	S	V	A	I	G	L	L	T	L	G	M	L	M	T	N	G	I	S	A	L	Q	N	T	T	V	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																						?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		M	G	L	P	F	S	F	V	I	F	F	V	M	A	G	L	Y	K	S	L	K	V	E	D	Y	R	R	E	S	A	N	R	D	T	A	P	R	P	L	G	L	Q	D	R	L	S	W	K	K	R	L	S	R	L	M	N	Y	P	G	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?	?
Disorder confidence
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Sequence		R	Y	T	K	Q	M	M	E	T	V	C	Y	P	A	M	E	E	V	A	Q	E	L	R	L	R	G	A	Y	V	E	L	K	S	L	P	P	E	E	G	Q	Q	L	G	H	L	D	L	L	V	H	M	G	E	E	Q	N	F	V	Y	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?		?	?					?		?	?	?	?	?	?	?	?	?								?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		I	W	P	Q	Q	Y	S	V	P	G	F	T	Y	R	A	R	S	G	K	S	T	Y	Y	R	L	E	T	F	L	L	E	G	S	Q	G	N	D	L	M	D	Y	S	K	E	Q	V	I	T	D	I	L	D	Q	Y	E	R	H	L	N	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		I	H	L	H	R	E	A	P	G	H	S	V	M	F	P	D	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand