Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P62601 Date Thu Jan 5 12:07:39 GMT 2012 Unique Job ID 90476ef97260f506

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	N	Q	K	I	Q	N	P	N	P	D	E	L	M	I	E	V	D	L	C	Y	E	L	D	P	Y	E	L	K	L	D	E	M	I	E	A	E	P	E	P	E	M	I	E	G	L	P	A	S	D	A	L	T	P	A	D	R	Y	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?		?																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	L	F	E	H	V	Q	S	A	K	I	F	P	D	S	K	T	F	P	D	C	A	P	K	M	D	P	L	D	I	L	I	R	Y	R	K	V	R	R	H	R	D	F	D	L	R	K	F	V	E	N	H	F	W	L	P	E	V	Y	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																								?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	E	Y	V	S	D	P	Q	N	S	L	K	E	H	I	D	Q	L	W	P	V	L	T	R	E	P	Q	D	H	I	P	W	S	S	L	L	A	L	P	Q	S	Y	I	V	P	G	G	R	F	S	E	T	Y	Y	W	D	S	Y	F	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		M	L	G	L	A	E	S	G	R	E	D	L	L	K	C	M	A	D	N	F	A	W	M	I	E	N	Y	G	H	I	P	N	G	N	R	T	Y	Y	L	S	R	S	Q	P	P	V	F	A	L	M	V	E	L	F	E	E	D	G	V	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	A	R	R	Y	L	D	H	L	K	M	E	Y	A	F	W	M	D	G	A	E	S	L	I	P	N	Q	A	Y	R	H	V	V	R	M	P	D	G	S	L	L	N	R	Y	W	D	D	R	D	T	P	R	D	E	S	W	L	E	D	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		E	T	A	K	H	S	G	R	P	P	N	E	V	Y	R	D	L	R	A	G	A	A	S	G	W	D	Y	S	S	R	W	L	R	D	T	G	R	L	A	S	I	R	T	T	Q	F	I	P	I	D	L	N	A	F	L	F	K	L	E	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	I	A	N	I	S	A	L	K	G	E	K	E	T	E	A	L	F	R	Q	K	A	S	A	R	R	D	A	V	N	R	Y	L	W	D	D	E	N	G	I	Y	R	D	Y	D	W	R	R	E	Q	L	A	L	F	S	A	A	A	I	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		P	L	Y	V	G	M	A	N	H	E	Q	A	D	R	L	A	N	A	V	R	S	R	L	L	T	P	G	G	I	L	A	S	E	Y	E	T	G	E	Q	W	D	K	P	N	G	W	A	P	L	Q	W	M	A	I	Q	G	F	K	M	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		G	D	D	L	L	G	D	E	I	A	R	S	W	L	K	T	V	N	Q	F	Y	L	E	Q	H	K	L	I	E	K	Y	H	I	A	D	G	V	P	R	E	G	G	G	G	E	Y	P	L	Q	D	G	F	G	W	T	N	G	V	V	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		R	L	I	G	L	Y	G	E	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand