Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AE16 Date Thu Jan 5 11:22:15 GMT 2012 Unique Job ID 8ffd68c6daada6d4

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	S	Q	Y	L	R	I	F	Q	Q	P	R	S	A	I	L	L	I	L	G	F	A	S	G	L	P	L	A	L	T	S	G	T	L	Q	A	W	M	T	V	E	N	I	D	L	K	T	I	G	F	F	S	L	V	G	Q	A	Y	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?		?	?	?																																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		F	K	F	L	W	S	P	L	M	D	R	Y	T	P	P	F	F	G	R	R	R	G	W	L	L	A	T	Q	I	L	L	L	V	A	I	A	A	M	G	F	L	E	P	G	T	Q	L	R	W	M	A	A	L	A	V	V	I	A	F	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	A	S	Q	D	I	V	F	D	A	W	K	T	D	V	L	P	A	E	E	R	G	A	G	A	A	I	S	V	L	G	Y	R	L	G	M	L	V	S	G	G	L	A	L	W	L	A	D	K	W	L	G	W	Q	G	M	Y	W	L	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	A	L	L	I	P	C	I	I	A	T	L	L	A	P	E	P	T	D	T	I	P	V	P	K	T	L	E	Q	A	V	V	A	P	L	R	D	F	F	G	R	N	N	A	W	L	I	L	L	L	I	V	L	Y	K	L	G	D	A	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	M	S	L	T	T	T	F	L	I	R	G	V	G	F	D	A	G	E	V	G	V	V	N	K	T	L	G	L	L	A	T	I	V	G	A	L	Y	G	G	I	L	M	Q	R	L	S	L	F	R	A	L	L	I	F	G	I	L	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	S	N	A	G	Y	W	L	L	S	I	T	D	K	H	L	Y	S	M	G	A	A	V	F	F	E	N	L	C	G	G	M	G	T	S	A	F	V	A	L	L	M	T	L	C	N	K	S	F	S	A	T	Q	F	A	L	L	S	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	A	V	G	R	V	Y	V	G	P	V	A	G	W	F	V	E	A	H	G	W	S	T	F	Y	L	F	S	V	A	A	A	V	P	G	L	I	L	L	L	V	C	R	Q	T	L	E	Y	T	R	V	N	D	N	F	I	S	R	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		Y	P	A	G	Y	A	F	A	M	W	T	L	A	A	G	V	S	L	L	A	V	W	L	L	L	L	T	M	D	A	L	D	L	T	H	F	S	F	L	P	A	L	L	E	V	G	V	L	V	A	L	S	G	V	V	L	G	G	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
Sequence		D	Y	L	A	L	R	K	T	H	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand