Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0ABS5 Date Thu Jan 5 11:16:14 GMT 2012 Unique Job ID 8fee6cce2e146eef

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	G	R	I	P	R	V	F	I	N	D	L	L	A	R	T	D	I	V	D	L	I	D	A	R	V	K	L	K	K	Q	G	K	N	F	H	A	C	C	P	F	H	N	E	K	T	P	S	F	T	V	N	G	E	K	Q	F	Y	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		C	F	G	C	G	A	H	G	N	A	I	D	F	L	M	N	Y	D	K	L	E	F	V	E	T	V	E	E	L	A	A	M	H	N	L	E	V	P	F	E	A	G	S	G	P	S	Q	I	E	R	H	Q	R	Q	T	L	Y	Q	L	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		D	G	L	N	T	F	Y	Q	Q	S	L	Q	Q	P	V	A	T	S	A	R	Q	Y	L	E	K	R	G	L	S	H	E	V	I	A	R	F	A	I	G	F	A	P	P	G	W	D	N	V	L	K	R	F	G	G	N	P	E	N	R	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																								?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	L	I	D	A	G	M	L	V	T	N	D	Q	G	R	S	Y	D	R	F	R	E	R	V	M	F	P	I	R	D	K	R	G	R	V	I	G	F	G	G	R	V	L	G	N	D	T	P	K	Y	L	N	S	P	E	T	D	I	F	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																										?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	G	R	Q	L	Y	G	L	Y	E	A	Q	Q	D	N	A	E	P	N	R	L	L	V	V	E	G	Y	M	D	V	V	A	L	A	Q	Y	G	I	N	Y	A	V	A	S	L	G	T	S	T	T	A	D	H	I	Q	L	L	F	R	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	N	N	V	I	C	C	Y	D	G	D	R	A	G	R	D	A	A	W	R	A	L	E	T	A	L	P	Y	M	T	D	G	R	Q	L	R	F	M	F	L	P	D	G	E	D	P	D	T	L	V	R	K	E	G	K	E	A	F	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		R	M	E	Q	A	M	P	L	S	A	F	L	F	N	S	L	M	P	Q	V	D	L	S	T	P	D	G	R	A	R	L	S	T	L	A	L	P	L	I	S	Q	V	P	G	E	T	L	R	I	Y	L	R	Q	E	L	G	N	K	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		I	L	D	D	S	Q	L	E	R	L	M	P	K	A	A	E	S	G	V	S	R	P	V	P	Q	L	K	R	T	T	M	R	I	L	I	G	L	L	V	Q	N	P	E	L	A	T	L	V	P	P	L	E	N	L	D	E	N	K	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		G	L	G	L	F	R	E	L	V	N	T	C	L	S	Q	P	G	L	T	T	G	Q	L	L	E	H	Y	R	G	T	N	N	A	A	T	L	E	K	L	S	M	W	D	D	I	A	D	K	N	I	A	E	Q	T	F	T	D	S	L	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?																								?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.
Sequence		H	M	F	D	S	L	L	E	L	R	Q	E	E	L	I	A	R	E	R	T	H	G	L	S	N	E	E	R	L	E	L	W	T	L	N	Q	E	L	A	K	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?	?															?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand