Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P31474 Date Thu Jan 5 11:48:02 GMT 2012 Unique Job ID 8f8da2dbea99631a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	D	K	K	K	R	S	M	A	G	L	P	W	I	A	A	M	A	F	F	M	Q	A	L	D	A	T	I	L	N	T	A	L	P	A	I	A	H	S	L	N	R	S	P	L	A	M	Q	S	A	I	I	S	Y	T	L	T	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?																																	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		M	L	I	P	V	S	G	W	L	A	D	R	F	G	T	R	R	I	F	T	L	A	V	S	L	F	T	L	G	S	L	A	C	A	L	S	N	S	L	P	Q	L	V	V	F	R	V	I	Q	G	I	G	G	A	M	M	M	P	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	L	A	L	L	R	A	Y	P	R	N	E	L	L	P	V	L	N	F	V	A	M	P	G	L	V	G	P	I	L	G	P	V	L	G	G	V	L	V	T	W	A	T	W	H	W	I	F	L	I	N	I	P	I	G	I	A	G	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Y	A	R	K	H	M	P	N	F	T	T	A	R	R	R	F	D	I	T	G	F	L	L	F	G	L	S	L	V	L	F	S	S	G	I	E	L	F	G	E	K	I	V	A	S	W	I	A	L	T	V	I	V	T	S	I	G	L	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	Y	I	L	H	A	R	R	T	P	N	P	L	I	S	L	D	L	F	K	T	R	T	F	S	I	G	I	V	G	N	I	A	T	R	L	G	T	G	C	V	P	F	L	M	P	L	M	L	Q	V	G	F	G	Y	Q	A	F	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	C	M	M	A	P	T	A	L	G	S	I	I	A	K	S	M	V	T	Q	V	L	R	R	L	G	Y	R	H	T	L	V	G	I	T	V	I	I	G	L	M	I	A	Q	F	S	L	Q	S	P	A	M	A	I	W	M	L	I	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	F	I	L	G	M	A	M	S	T	Q	F	T	A	M	N	T	I	T	L	A	D	L	T	D	D	N	A	S	S	G	N	S	V	L	A	V	T	Q	Q	L	S	I	S	L	G	V	A	V	S	A	A	V	L	R	V	Y	E	G	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?		?	?				?	?	?																										?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.
Sequence		E	G	T	T	T	V	E	Q	F	H	Y	T	F	I	T	M	G	I	I	T	V	A	S	A	A	M	F	M	L	L	K	T	T	D	G	N	N	L	I	K	R	Q	R	K	S	K	P	N	R	V	P	S	E	S	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand