Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P71241 Date Thu Jan 5 12:12:36 GMT 2012 Unique Job ID 8f82f087a9b3ebf2

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	N	L	K	K	R	E	R	A	K	T	N	A	S	L	I	S	M	V	Q	R	F	S	D	I	T	I	M	F	A	G	L	W	L	V	C	E	V	S	G	L	S	F	L	Y	M	H	L	L	V	A	L	I	T	L	V	V	F	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?			?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		M	L	G	G	I	T	D	F	Y	R	S	W	R	G	V	R	A	A	T	E	F	A	L	L	L	Q	N	W	T	L	S	V	I	F	S	A	G	L	V	A	F	N	N	D	F	D	T	Q	L	K	I	W	L	A	W	Y	A	L	T	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?																											?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	G	L	V	V	C	R	S	C	I	R	I	G	A	G	W	L	R	N	H	G	Y	N	K	R	M	V	A	V	A	G	D	L	A	A	G	Q	M	L	M	E	S	F	R	N	Q	P	W	L	G	F	E	V	V	G	V	Y	H	D	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		K	P	G	G	V	S	N	D	W	A	G	N	L	Q	Q	L	V	E	D	A	K	A	G	K	I	H	N	V	Y	I	A	M	Q	M	C	D	G	A	R	V	K	K	L	V	H	Q	L	A	D	T	T	C	S	V	L	L	I	P	D	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?																														?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		F	T	F	N	I	L	H	S	R	L	E	E	M	N	G	V	P	V	V	P	L	Y	D	T	P	L	S	G	V	N	R	L	L	K	R	A	E	D	I	V	L	A	T	L	I	L	L	L	I	S	P	V	L	C	C	I	A	L	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?					?													?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		K	L	S	S	P	G	P	V	I	F	R	Q	T	R	Y	G	M	D	G	K	P	I	K	V	W	K	F	R	S	M	K	V	M	E	N	D	K	V	V	T	Q	A	T	Q	N	D	P	R	V	T	K	V	G	N	F	L	R	R	T	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																									?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	D	E	L	P	Q	F	I	N	V	L	T	G	G	M	S	I	V	G	P	R	P	H	A	V	A	H	N	E	Q	Y	R	Q	L	I	E	G	Y	M	L	R	H	K	V	K	P	G	I	T	G	W	A	Q	I	N	G	W	R	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.
Sequence		T	D	T	L	E	K	M	E	K	R	V	E	F	D	L	E	Y	I	R	E	W	S	V	W	F	D	I	K	I	V	F	L	T	V	F	K	G	F	V	N	K	A	A	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?																																		?		?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand