Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q9JMS5 Date Wed Jan 25 15:21:16 GMT 2012 Unique Job ID 8f820e0254565e26

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	C	F	F	L	G	S	R	L	A	Y	A	E	N	I	D	G	S	S	T	I	S	N	R	D	I	S	G	S	L	N	I	G	I	N	K	D	A	N	I	D	I	N	G	T	V	N	I	K	D	Y	F	S	V	A	T	C	N	G	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?			?	?	?					?	?										?	?	?	?											?	?		?		?			?						?			?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	S	T	C	P	E	G	G	L	N	A	S	A	K	I	D	K	S	A	S	V	G	A	S	V	T	I	V	G	D	S	S	K	G	E	L	N	I	D	G	G	S	T	L	Y	T	Q	Q	L	W	V	S	G	N	D	N	D	K	T	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?		?		?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		N	V	S	D	D	S	N	G	S	L	S	I	N	N	G	S	N	V	F	V	V	S	S	Q	D	D	T	P	F	K	T	N	S	V	K	W	N	Q	N	I	I	S	Q	G	N	N	I	T	D	G	T	V	S	S	G	D	L	V	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?			?	?																			?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?		?					?			?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		K	T	G	N	G	I	I	D	I	D	N	N	S	K	L	D	V	K	N	D	V	V	V	S	T	G	V	D	G	I	P	N	E	K	P	S	E	I	N	I	K	N	E	S	N	F	S	V	H	G	D	M	K	G	G	I	S	A	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?					?	?		?				?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?			?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	L	N	L	N	M	D	N	S	S	N	L	H	V	D	K	N	I	A	V	G	I	G	R	E	S	N	I	T	V	S	A	S	R	E	S	S	I	F	S	D	G	N	F	T	V	A	T	G	N	N	S	N	A	N	L	K	L	D	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?				?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?			?	?	?						?		?	?		?	?					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	N	L	S	V	N	G	V	S	T	I	G	S	G	D	G	S	I	T	K	F	D	I	K	N	G	S	V	V	T	S	S	S	D	M	T	L	A	K	G	K	G	T	Q	A	N	I	N	I	S	S	S	E	L	N	T	G	S	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?			?	?	?					?	?					?					?	?						?	?		?	?							?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		V	G	E	G	D	N	A	D	V	K	M	T	G	S	G	A	S	V	S	S	K	K	T	F	T	V	A	K	G	N	N	A	S	A	T	L	N	Y	T	G	S	K	I	D	I	G	S	G	Y	I	G	E	G	E	S	A	K	T	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?										?	?	?	?	?	?	?					?	?		?		?	?							?	?				?	?		?			?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		E	L	N	N	S	A	L	T	A	S	G	K	V	F	I	G	Q	G	N	T	T	Q	T	N	L	T	L	N	D	K	S	S	V	N	V	S	G	E	M	S	V	A	Q	G	S	S	A	S	V	D	V	T	A	T	N	A	V	L	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?										?				?	?	?	?	?				?		?	?					?	?	?				?	?		?	?	?						?	?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		D	S	L	S	L	G	G	G	E	A	A	K	V	T	M	T	G	S	G	A	T	V	S	S	K	N	T	F	T	V	A	K	G	N	N	A	S	A	T	L	D	Y	T	D	S	K	I	D	I	G	S	G	Y	I	G	E	G	E	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?			?	?		?	?	?					?	?	?	?	?			?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?				?	?	?	?			?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		K	T	Q	L	E	L	N	N	S	A	L	T	A	S	G	K	V	F	I	G	Q	G	N	T	T	Q	T	N	L	T	L	N	D	K	S	S	V	N	V	S	D	E	M	S	V	A	Q	G	S	S	A	S	V	D	V	T	I	T	N	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?				?	?	?	?	?			?		?					?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		V	L	S	A	D	S	L	S	L	G	G	G	E	A	A	K	V	T	M	T	G	N	R	A	T	I	S	S	G	N	T	F	T	V	A	K	G	N	N	A	S	A	T	L	D	Y	S	D	S	K	I	N	I	G	N	G	Y	I	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?					?		?								?	?				?	?		?		?						?		?	?				?	?	?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		G	E	K	A	Q	T	V	L	T	L	K	D	S	A	L	A	A	T	G	D	V	I	M	G	Q	G	Q	E	T	Q	T	D	L	T	L	S	P	Q	S	S	I	K	V	S	G	N	M	S	I	A	Q	G	N	A	A	S	A	K	V	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?				?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		V	D	N	A	D	L	S	A	N	S	M	S	I	G	E	G	D	T	A	A	V	T	M	T	G	N	G	A	T	I	S	S	G	N	T	F	T	V	A	R	G	N	N	A	S	A	T	L	D	Y	S	D	S	K	I	N	I	G	N	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?				?	?	?	?		?		?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?				?	?	?						?		?	?	?						?	?	?	?				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		Y	I	G	G	G	E	K	A	Q	T	V	L	T	L	K	D	S	A	L	A	A	T	G	D	V	I	M	G	Q	G	Q	E	T	Q	T	D	L	T	L	S	P	Q	S	S	I	K	V	S	G	N	M	S	I	A	Q	G	N	A	A	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?		?	?							?	?	?	?	?			?							?	?		?	?	?	?	?	?	?					?	?	?											?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		A	K	V	I	V	D	N	A	D	L	S	A	N	S	M	S	I	G	E	G	D	T	A	A	V	T	M	T	G	N	G	A	T	I	S	S	G	N	T	F	T	V	A	R	G	N	N	A	S	A	T	L	D	Y	S	D	S	K	I	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?					?		?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?			?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		I	G	N	G	Y	I	G	V	G	E	K	S	H	T	L	L	K	L	D	N	S	T	F	H	A	A	G	N	I	D	I	G	K	G	S	S	T	I	A	N	V	S	V	G	A	G	S	N	M	S	I	K	G	N	A	S	I	G	V	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?		?	?																?														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		D	Q	A	K	A	K	F	S	V	K	D	S	V	L	N	I	G	S	S	L	V	L	G	Q	G	N	S	T	E	A	E	M	S	V	E	H	S	Q	L	Y	S	G	G	L	L	L	G	T	A	N	N	A	V	V	S	M	S	A	N	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?							?	?	?	?			?	?							?			?	?	?				?	?	?	?	?	?				?						?	?	?	?	?	?						?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		S	E	I	S	V	V	G	D	Y	T	V	A	K	G	D	G	S	E	A	T	L	I	Y	K	N	S	D	I	N	L	G	N	G	I	L	G	A	G	S	G	V	K	T	D	L	S	L	D	N	S	K	F	V	A	S	D	G	I	I	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?																								?					?	?		?	?	?	?	?	?			?	?		?					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		G	K	G	D	N	A	I	T	N	L	S	I	S	D	H	S	V	F	K	G	E	R	I	N	I	G	N	G	S	Y	S	K	N	S	I	S	I	T	G	N	S	I	F	D	F	G	S	S	Q	E	S	T	I	G	E	G	D	Y	S	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?			?	?								?	?		?	?	?		?								?				?													?		?	?	?	?				?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
Sequence		S	L	V	T	I	N	D	A	S	V	Y	G	D	G	S	L	T	L	A	K	G	N	N	S	F	A	V	L	N	L	Q	D	N	A	V	T	N	A	N	N	I	S	L	A	T	G	L	G	S	K	A	I	V	N	V	S	N	M	N	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?				?										?							?	?	?							?		?				?				?		?			?					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260
Sequence		G	Q	F	N	P	V	S	M	G	A	G	D	G	Y	A	E	V	N	F	D	G	V	N	G	Y	T	L	S	T	N	F	I	C	M	D	S	G	S	C	A	D	T	V	I	N	V	N	R	G	T	V	S	L	S	G	T	N	D	W	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?				?	?																						?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320
Sequence		G	Q	I	N	V	Y	D	G	T	R	L	D	A	R	G	N	D	A	V	D	G	I	L	N	V	S	K	E	A	Q	V	D	F	N	G	Y	S	Q	H	M	T	G	I	D	N	K	G	M	I	Y	L	S	D	G	S	A	S	S	D	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?						?					?												?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380
Sequence		Y	L	D	K	D	Y	V	A	H	D	G	S	G	V	Q	F	G	I	F	G	Q	K	E	A	D	V	M	H	V	K	G	D	T	S	G	S	S	G	I	V	V	T	T	N	S	K	N	K	I	K	K	G	G	D	I	L	L	V	E	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440
Sequence		N	G	D	S	S	G	S	F	Y	L	N	S	L	I	K	N	G	K	E	Y	K	V	T	G	D	Y	I	D	V	G	A	W	E	Y	A	L	N	K	K	R	K	N	W	Y	L	S	V	D	M	R	P	E	P	G	A	F	I	N	N	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1500
Sequence		K	S	M	L	D	M	F	A	L	Q	R	Y	D	I	P	G	Q	H	R	Y	P	T	L	F	E	N	L	Y	N	N	G	M	W	I	Q	F	N	N	N	S	G	S	N	S	E	V	Y	D	N	L	K	T	S	Y	S	L	N	T	M	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1560
Sequence		I	G	G	D	I	Y	N	W	T	D	G	Y	N	Y	S	H	I	G	I	M	G	G	M	G	S	A	A	N	K	T	T	S	T	N	N	K	R	A	T	G	N	V	D	G	Y	T	L	G	L	Y	H	V	F	Q	Q	N	I	S	D	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?															?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1620
Sequence		L	N	E	S	E	R	Q	G	L	W	T	Y	S	S	I	Q	Y	M	D	Y	D	N	S	V	S	S	T	N	N	F	K	A	N	Y	G	V	N	G	F	R	L	T	G	E	V	G	Y	L	K	N	I	G	G	I	Q	P	S	D	F	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																				?			?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1680
Sequence		V	E	P	K	L	Y	L	S	H	T	E	L	S	G	G	V	V	E	D	L	Q	G	G	K	I	T	Y	P	N	S	L	T	I	I	E	P	G	V	F	F	S	Y	R	K	T	H	E	S	T	S	N	D	E	A	M	F	K	D	Y	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?				?	?		?	?				?	?	?	?	?		?						?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1740
Sequence		K	Q	S	V	V	D	A	W	F	G	G	G	Y	S	F	K	T	G	N	Y	S	R	T	N	F	D	S	D	M	V	E	Y	N	T	S	D	N	F	A	L	K	S	G	V	E	F	E	F	L	K	D	A	R	L	L	L	T	S	S	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1750	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		S	I	N	N	D	R	N	L	S	F	I	L	G	G	N	Y	Y	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?											?	?
Disorder confidence