Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76097 Date Thu Jan 5 12:18:52 GMT 2012 Unique Job ID 8ecf7f5bd09ea167

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	N	S	I	T	A	D	E	I	R	E	Q	F	S	Q	A	M	S	A	M	Y	Q	Q	E	V	P	Q	Y	G	T	L	L	E	L	V	A	D	V	N	L	A	V	L	E	N	N	P	Q	L	H	E	K	M	V	N	A	D	E	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																																								?	?	?	?					?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	R	L	N	V	E	R	H	G	A	I	R	V	G	T	A	Q	E	L	A	T	L	R	R	M	F	A	I	M	G	M	Y	P	V	S	Y	Y	D	L	S	Q	A	G	V	P	V	H	S	T	A	F	R	P	I	D	D	A	S	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?																													?				?										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	N	P	F	R	V	F	T	S	L	L	R	L	E	L	I	E	N	E	I	L	R	Q	K	A	A	E	I	L	R	Q	R	D	I	F	T	P	R	C	R	Q	L	L	E	E	Y	E	Q	Q	G	G	F	N	E	T	Q	A	Q	E	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?	?	?	?																?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	Q	E	A	L	E	T	F	R	W	H	Q	S	A	T	V	D	E	E	T	Y	R	A	L	H	N	E	H	R	L	I	A	D	V	V	C	F	P	G	C	H	I	N	H	L	T	P	R	T	L	D	I	D	R	V	Q	S	M	M	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?		?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	C	G	I	E	P	K	I	L	I	E	G	P	P	R	R	E	V	P	I	L	L	R	Q	T	S	F	K	A	L	E	E	T	V	L	F	A	G	Q	K	Q	G	T	H	T	A	R	F	G	E	I	E	Q	R	G	V	A	L	T	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?																												?					?	?	?	?	?	?	?															?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		K	G	R	Q	L	Y	D	D	L	L	R	N	A	G	T	G	Q	D	N	L	T	H	Q	M	H	L	Q	E	T	F	R	T	F	P	D	S	E	F	L	M	R	Q	Q	G	L	A	W	F	R	Y	R	L	T	P	S	G	E	A	H	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?	?	?	?																																			?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		Q	A	I	H	P	G	D	D	P	Q	P	L	I	E	R	G	W	V	V	A	Q	P	I	T	Y	E	D	F	L	P	V	S	A	A	G	I	F	Q	S	N	L	G	N	E	T	Q	T	R	S	H	G	N	A	S	R	E	A	F	E	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?																											?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		A	L	G	C	P	V	L	D	E	F	Q	L	Y	Q	E	A	E	E	R	S	K	R	R	C	G	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand